Résumé
L'étude des bases génétiques de l'adaptation des plantes est essentielle pour comprendre les processus évolutifs et faire progresser l'amélioration des cultures. Traditionnellement, les bases génétiques de l'adaptation ont été explorés soit au sein d'une même espèce (génomique des populations, génétique quantitative), soit à plus grande échelle, en comparant des espèces présentant des caractères différents (phylogénomique comparative). Nous préconisons ici d'intégrer des approches à l'échelle micro- et macroévolutive afin de mieux élucider les mécanismes génétiques qui sous-tendent l'adaptation des plantes à leur environnement. Nous présentons des études et des méthodes qui étendent les analyses intraspécifiques à des contextes interspécifiques et vice versa, démontrant ainsi leur contribution à la compréhension fonctionnelle de l'adaptation des plantes. Nous abordons également les méthodes émergentes de comparaisons multi-espèces de la génomique des populations, et ce qu’elles révèlent sur l’architecture génétique de l’adaptation répétée entre les espèces. Enfin, nous mettons en évidence les questions biologiques clés et les avancées méthodologiques nécessaires pour renforcer ces approches intégratives. L’émergence de méthodes plus holistiques, favorisée par des ensembles de données génomiques plus vastes et de meilleure qualité, améliorera encore notre capacité à comprendre et à prédire les dynamiques évolutives, nous permettant ainsi d’exploiter pleinement le potentiel de l’adaptation des plantes.