Chromosomal resolution reveals symbiotic virus colonization of parasitic wasp genomes

Jérémy Gauthier; Hélène Boulain; Joke J.F.A. van Vugt; Lyam Baudry; Emma Persyn; Jean-Marc Aury; Benjamin Noel; Anthony Bretaudeau; Fabrice Legeai; Sven Warris; Mohamed Amine Chebbi; Géraldine Dubreuil; Bernard Duvic; Natacha Kremer; Philippe Gayral; Karine Musset; Thibaut Josse; Diane Bigot; Christophe Bressac; Sébastien Moreau; Georges Périquet; Myriam Harry; Nicolas Montagne; Isabelle Boulogne; Mahnaz Sabeti-Azad; Martine Maïbèche; Thomas Chertemps; Frédérique Hilliou; David Siaussat; Joëlle Amselem; Isabelle Luyten; Claire Capdevielle-Dulac; Karine Labadie; Bruna Laís Merlin; Valérie Barbe; Jetske de Boer; Martial Marbouty; Fernando Luis Cônsoli; Stéphane Dupas; Aurélie Hua Van; Gaëlle Le Goff; Annie Bézier; Emmanuelle Jacquin-Joly; James Whitfield; Louise E.M. Vet; Hans Smid; Laure Kaiser; Romain Koszul; Elisabeth Huguet; Elisabeth A. Herniou; Jean-Michel Drezen

doi:10.1101/2020.03.19.994459

Chromosomal resolution reveals symbiotic virus colonization of parasitic wasp genomes

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Open Access

Chromosomal resolution reveals symbiotic virus colonization of parasitic wasp genomes

Jérémy Gauthier, Hélène Boulain, Joke J.F.A. van Vugt, Lyam Baudry, Emma Persyn, Jean-Marc Aury, Benjamin Noel, Anthony Bretaudeau, Fabrice Legeai, Sven Warris, …

DOI: https://doi.org/10.1101/2020.03.19.994459

Résumé

Most endogenous viruses, an important proportion of eukaryote genomes, are doomed to slowly decay. Little is known, however, on how they evolve when they confer a benefit to their host. Bracoviruses are essential for the parasitism success of parasitoid wasps, whose genomes they integrated ~103 million years ago. Here we show, from the assembly of a parasitoid wasp genome, for the first time at a chromosomal scale, that symbiotic bracovirus genes spread to and colonized all the chromosomes. Moreover, large viral clusters are stably maintained suggesting strong evolutionary constraints. Genomic comparison with another wasps revealed that this organization was already established ~53 mya. Transcriptomic analyses highlight temporal synchronization of viral gene expression, leading to particle production. Immune genes are not induced, however, indicating the virus is not perceived as foreign by the wasp. This recognition suggests that no conflicts remain between symbiotic partners when benefits to them converge.

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Détails

Titre: Chromosomal resolution reveals symbiotic virus colonization of parasitic wasp genomes
Créateurs - sans rôle: Jérémy Gauthier - Université de Tours
Hélène Boulain - Université de Tours
Joke J.F.A. van Vugt - Netherlands Institute of Ecology
Lyam Baudry - Centre National de la Recherche Scientifique
Emma Persyn - Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris
Jean-Marc Aury - Laboratoire de Bioinformatique pour la Génomique et la Biodiversité
Benjamin Noel - CEA Paris-Saclay
Anthony Bretaudeau - Centre National de la Recherche Scientifique
Fabrice Legeai - Université de Rennes
Sven Warris - Wageningen University & Research
Mohamed Amine Chebbi - Université de Tours
Géraldine Dubreuil - Centre National de la Recherche Scientifique
Bernard Duvic - Université de Montpellier, Diversité, Génomes et Interactions Microorganismes-Insectes - DGIMI
Natacha Kremer - Centre National de la Recherche Scientifique
Philippe Gayral - Centre National de la Recherche Scientifique
Karine Musset - Université de Tours
Thibaut Josse - Université de Tours
Diane Bigot - Université de Tours
Christophe Bressac - Université de Tours
Sébastien Moreau - Université de Tours
Georges Périquet - Centre National de la Recherche Scientifique
Myriam Harry - Université Paris-Saclay
Nicolas Montagne - Sorbonne Université
Isabelle Boulogne - Sorbonne Université
Mahnaz Sabeti-Azad - Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris
Martine Maïbèche - Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris
Thomas Chertemps - Sorbonne Université
Frédérique Hilliou - Université Côte d'Azur
David Siaussat - Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris
Joëlle Amselem - Université Paris-Saclay
Isabelle Luyten - Université Paris-Saclay
Claire Capdevielle-Dulac - Université Paris-Saclay
Karine Labadie - Commissariat à l'Énergie Atomique et aux Énergies Alternatives
Bruna Laís Merlin - Universidade de São Paulo
Valérie Barbe - CEA Paris-Saclay
Jetske de Boer - Netherlands Institute of Ecology
Martial Marbouty - Centre National de la Recherche Scientifique
Fernando Luis Cônsoli - Universidade de São Paulo
Stéphane Dupas - Université Paris-Sud
Aurélie Hua Van - Evolution, génomes, comportement et écologie
Gaëlle Le Goff - Institut Sophia Agrobiotech
Annie Bézier - Université de Tours
Emmanuelle Jacquin-Joly - Sorbonne Université
James Whitfield - University of Illinois Urbana-Champaign
Louise E.M. Vet - Netherlands Institute of Ecology
Hans Smid - Wageningen University & Research
Laure Kaiser - Evolution, génomes, comportement et écologie
Romain Koszul - Centre National de la Recherche Scientifique
Elisabeth Huguet - Centre National de la Recherche Scientifique
Elisabeth A. Herniou - Université de Tours
Jean-Michel Drezen - Institut de recherche sur la biologie de l'insecte
Identifiants: 99151307609311
Unité académique: Diversité, Génomes et Interactions Microorganismes-Insectes - DGIMI
Langue: English
Type de ressource: Working paper
Champs locaux: hal-03090838