Résumé
Suite à l’incendie de 2017, qui a ravagé 500 hectares sur les « Trois Caps », un protocole de suivi de la recolonisation de la tortue d’Hermann (Testudo hermanni Gmelin, 1789) sur des mailles de cinq hectares a été mis en place en 2018 par le Parc national de Port-Cros (PNPC), avec l’appui du Conservatoire d’espaces naturels de PACA et de la SOPTOM. Le PNPC a proposé de revoir ce protocole, sur la base d’une analyse statistique des données de présence-absence de l’espèce collectées pen-dant six ans au sein des mailles. Nous avons d’abord extrait plusieurs variables environnementales (typologies d’habitats, incendie, topographie) à partir d’une analyse SIG. Une Analyse en Composantes Principales (ACP) et un clustering nous ont permis d’identifier parmi ces variables lesquelles expliquaient la plus forte part de variance observée entre mailles prospectées et de définir des groupes de mailles similaires entre elles. Des modèles de site-occupancy dynamique nous ont ensuite permis d’identifier quelles va-riables agissent sur la dynamique d’occupation de l’espèce tout en corrigeant les problèmes de détection. Nos résultats confirment la forte diminution de la probabilité d’occupation initiale (psi) avec l’augmentation de la surface incendiée en 2017. Nous observons également une probabilité de colonisation (gamma) élevée (42 %), favorisée par les recouvrements en habitats à arbustes hauts au sein des mailles. La probabilité de détection (p) de l’espèce est très faible (11 %). Elle diminue avec l’augmentation du recouvrement en habitats d’herbacées et rochers, sur les mailles exposées sud-ouest et lors de prospections réalisées lors de températures élevées. p varie également selon les structures (et/ou leurs techniques de prospection) ayant réalisé les prospections. Des tests de puissance à partir de simulations ont mis en évidence l’importance d’augmenter p et nous proposons plusieurs pistes pour y parvenir. Ces tests de puissance montrent par ailleurs qu’il serait nécessaire d’échantillonner 50 mailles avec 5 visites par maille pour obtenir une puissance statistique satisfaisante pour mettre en évidence des baisses ou des augmentations de l’occupation de l’espèce de 27% après quatre campagnes de terrain. Sur la base de ces résultats, nous proposons un échantillonnage spatialement équilibré réalisé tous les cinq ans afin de poursuivre le suivi de la dynamique d’occupation de la tortue d’Hermann sur le territoire des Trois Caps. Ce document justifie les choix méthodologiques réalisés et propose un cadre pour le recueil, le stockage et l’analyse des données. Il fixe également les moyens logistiques nécessaires à la mise en œuvre du protocole proposé. L’ensemble de ces informations garantit la pérennité de l’étude sur le long terme.