Quantitative Chromosome Conformation Capture (3C-qPCR)

Cosette Rebouissou; Séphora Sallis; Thierry Forné

doi:10.1007/978-1-0716-2497-5_1

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Quantitative Chromosome Conformation Capture (3C-qPCR)

Article de revue

Open Access

Quantitative Chromosome Conformation Capture (3C-qPCR)

Cosette Rebouissou, Séphora Sallis et Thierry Forné

Methods in Molecular Biology, Vol.2532, pp.3-13

Spatial Genome Organization: Methods and Protocols

23/07/2022

DOI: https://doi.org/10.1007/978-1-0716-2497-5_1

PMID: 35867242

Résumé

eukaryotic genome

interaction frequency

Quantitative PCR

chromatin dynamics and organization

Chromosome Conformation Capture

Chromatin / genetics

Many population-based methods investigating chromatin dynamics and organization in eukaryotes are based on the Chromosome Conformation Capture (3C) method. Here, we provide an updated version of the quantitative 3C (3C-qPCR) protocol for improved and simplified quantitative analyses of intra-chromosomal contacts.

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Détails

Titre: Quantitative Chromosome Conformation Capture (3C-qPCR)
Créateurs - sans rôle: Cosette Rebouissou - Université de Montpellier, Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier - IGMM
Séphora Sallis - Université de Montpellier, Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier - IGMM
Thierry Forné - Université de Montpellier, Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier - IGMM
Détails de publication: Methods in Molecular Biology, Vol.2532, pp.3-13
Publications en série: Spatial Genome Organization: Methods and Protocols
Note de subvention: AFM-Téléthon grant N°21024
Identifiants: 99151982609311
Unité académique: Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier - IGMM
Langue: English
Type de ressource: Journal article
Champs locaux: hal-03500295