Résumé
Cet article présente les enjeux de l'ingénierie des connaissances dans le domaine des sciences du vivant et, à titre d'illustration, un système d'intégration de données thématiques ouvert sur le Web, appelé ONDINE (Ontology based Data INtEgration). Ce système propose un processus complet d'acquisition, d'annotation sémantique et d'interrogation de données à partir de tableaux trouvés dans des documents scientifiques issus du Web. L'élément central du système ONDINE est une Ressource Termino-Ontologique (RTO) qui permet la représentation de relations n-aires et dont les concepts sont utilisés pour annoter des tableaux de données. Nous présentons le modèle de la RTO, la méthode d'annotation semi-automatique de tableaux de données guidée par cette RTO, puis le logiciel @Web (Annotating Tables from the Web) d'annotation sémantique de tableaux.