HIV-1 subtype B-infected MSM may have driven the spread of transmitted resistant strains in France in 2007–12: impact on susceptibility to first-line strategies

Pierre Frange; Pierre Assoumou; Diane Descamps; Antoine Chéret; Cécile Goujard; Laurent Tran; Marine Gousset; Véronique Avettand-Fenoël; Laurence Bocket; Samira Tran; Jérôme Guinard; Pierre Morand-Joubert; Florence Nicot; Jean-Christophe Plantier; Sylvie Rogez; Pierre Wirden; Christine Rouzioux; Laurence Meyer; Marie-Laure Chaix; S. Abel; B. Abraham; A. Antoniotti; R. Armero; B. Audhuy; H. Aumaitre; G. Beaucaire; G. Beck-Wirth; J.L. Berger; L. Bernard; C. Beuscart; L. Bodard; O. Bouchaud; F. Boue; J.-P. Cabane; A. Cabié; H. Champagne; C. Cheneau; J.-M. Chennebault; A. Cheret; B. Christian; A. Compagnucci; V. Daneluzzi; Y. Debab; P. Dellamonica; F. Delfraissy; A. Devidas; G. Diab; J. Doll; C. Drobacheff-Thebaut; A. Durel; L. Esnault; L. Faba; E. Froguel; D. Garipuy; V. Garrait; L. Geffray; C. Genet; P. Genet; L. Gérard; J. Ghosn; J. Girard; Pascal Girard; C. Godin-Collet; P. Hochedez; B. Hoen; D. Houlbert; C. Jacomet; V. Jeantils; K. Jidar; E. Klement; A. Lafeuillade; V. Launay; A. Leprêtre; Y. Levy; D. Makhloufi; D. Malbec; B. Martha; T. May; D. Merrien; P. Miailhes; C. Miodovski; P. Morlat; E. Mortier; D. Neau; M. Obadia; O. Patey; L. Pellegrin; V. Perronne; P. Philibert; G. Pialoux; G. Pichancourt; L. Piroth; Y. Poinsignon; I. Poizot-Martin; T. Prazuck; V. Prendki; F. Du Clary; D. Quinsat; A. Regnier; J. Reynes; E. Rosenthal; E. Rouveix; D. Salmon; F. Salanville; L. Schmitt; A. Simon-Coutellier; A. Sotto; F. Souala; A. Stein; F. Timsit; P. de Truchis; A. Uludag; O. Vaillant; R. Verdon; A. Verlesch-Langlin; J.-P. Viard; D. Vittecoq; L. Weiss; P. Yéni; D. Zucman; C. Allavena; T. Allegre; I. Amri; B. Autran; C. Bacchus; C. Blanc; S. Bonne; B. Bonne; S. Bouchez; C. Charlier; H. Consigny; C. Duvivier; E. Fourn; F. Guiroy; T. Huleux; C. Katlama; C. Lascoux; A. Leplatois; T. Lyavanc; J.-M. Molina; A. Naqvi; G. Nembot; Y. Quertainmont; F. Raffi; A. Samri; L. Schneider; S. Seang; B. Seksik; M. Shoai-Tehrani; L. Slama; A. Valentin; Y. Yazdanpanah; C. Alloui; C. Amiel; P. André; E. André; G. Anies; F. Barin; P. Bellecave; D. Bettinger; M. Bouvier-Alias; F. Brun-Vézinet; A. Calmy; V. Calvez; W. Caveng; A. Chaillon; S. Chapalay; C. Charpentier; D. Costagliola; J. Cottalorda; C. Delamare; C. Delaugerre; J. Dina; G. Santos; V. Ferre; P. Flandre; H. Fleury; S. Fourati; C. Gaille; G. Giraudeau; A. Guigon; S. Haim-Boukobza; E. Lagier; H. Le Guillou-Guillemette; C. Henquell; Jacques Izopet; Lambert Lambert-Niclot; M. Leroux; A. Maillard; I. Malet; Marc Marcelin; S. Marque-Juillet; B. Masquelier; A. Mirand; P. Morand; B Montes; L. Mouna; C. Noel; C. Pallier; G. Peytavin; P. Pinson-Recordon; J. Poveda; S. Raymond; S. Reigadas; A. Roques; A. de Rougemont; C. Roussel; P. Schmitt; V. Schneider; E. Schvoerer; A. Signori-Schmuck; C. Soulié; C. Tamalet; C. Tardy; A. Trabaud; A. Vabret; S. Vallet; S. Yerly

doi:10.1093/jac/dkv049

Journal article

HIV-1 subtype B-infected MSM may have driven the spread of transmitted resistant strains in France in 2007–12: impact on susceptibility to first-line strategies

Pierre Frange, Pierre Assoumou, Diane Descamps, Antoine Chéret, Cécile Goujard, Laurent Tran, Marine Gousset, Véronique Avettand-Fenoël, Laurence Bocket, Samira Tran, …

Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Vol.70(7), pp.2084-2089

01/07/2015

DOI: https://doi.org/10.1093/jac/dkv049

Abstract

Resistance-associated mutations

Primary HIV infection

HIV-1

Background: Our study describes the prevalence of transmitted drug resistance (TDR) among 1318 French patients diagnosed at the time of primary HIV-1 infection (PHI) in 2007-12.Methods: HIV-1 resistance-associated mutations (RAMs) were characterized using both the 2009 WHO list of mutations and the French ANRS algorithm. A genotypic susceptibility score was estimated for each first-line recommended ART combination.Results: Patients were mainly MSM (72.6%). Non-B variants were identified in 33.7% of patients. The proportion of TDR was estimated as 11.7% (95% CI 10.0-13.5). The prevalences of PI-, NRTI-, first-generation NNRTI and etravirine/rilpivirine-associated RAMs were 2.5%, 5.2%, 3.9% and 3.2%, respectively. Single, dual and triple class resistance was found in 9.6%, 1.0% and 1.1% of cases, respectively. Additionally, 5/331 strains isolated in 201012 had integrase inhibitor (II)-related RAMs (isolated E157Q mutation in all cases). TDR was more common among MSM than in other groups (12.9% versus 8.6%, P = 0.034), and in case of B versus non-B subtype infections (13.6% versus 7.9%, P = 0.002). The proportions of fully active combinations were >= 99.2%, >= 97.3% and >= 95.3% in cases of PI-, II- and NNRTI-based regimens, respectively. In 2010-12, the proportion of fully active efavirenz-based ART was lower in cases of subtype B versus non-B infection (P = 0.021).Conclusions: Compared with our previous studies, the proportion of NRTI- and first-generation NNRTI-related TDR has continued to decline in French seroconverters. However, subtype B-infected MSM could drive the spread of resistant HIV strains. Finally, we suggest preferring PI- or II- to NNRTI-based combinations to treat PHI patients.

Files and links (1)

url

Find in HALView

Metrics

1 Record Views

See more details

Details

Title: HIV-1 subtype B-infected MSM may have driven the spread of transmitted resistant strains in France in 2007–12: impact on susceptibility to first-line strategies
Creators - without role: Pierre Frange - Hôpital Necker-Enfants Malades
Pierre Assoumou
Diane Descamps - Hôpital Bichat-Claude-Bernard
Antoine Chéret - Université Paris Cité
Cécile Goujard - Centre de recherche en Epidémiologie et Santé des Populations
Laurent Tran - Bicêtre Hospital
Marine Gousset - Hôpital Necker-Enfants Malades
Véronique Avettand-Fenoël - Hôpital Necker-Enfants Malades
Laurence Bocket - Centre Hospitalier Universitaire de Lille
Samira Tran
Jérôme Guinard - Centre hospitalier régional d'Orléans
Pierre Morand-Joubert
Florence Nicot - Hôpital Purpan
Jean-Christophe Plantier - Charmo University
Sylvie Rogez - Virologie
Pierre Wirden
Christine Rouzioux - Hôpital Necker-Enfants Malades
Laurence Meyer - Inserm
Marie-Laure Chaix - Virologie
S. Abel - Systèmes Membranaires, Photobiologie, Stress et Détoxication
B. Abraham - Sorbonne Université
A. Antoniotti - Université Paris Cité
R. Armero - Inserm
B. Audhuy - Sorbonne Université
H. Aumaitre - Inserm
G. Beaucaire - Centre Hospitalier Universitaire de Limoges
G. Beck-Wirth - Centre Hospitalier Universitaire de Limoges
J.L. Berger - Université Paris Cité
L. Bernard - Département de Pharmacie
C. Beuscart - Université Paris Cité
L. Bodard - Délégation Paris 7
O. Bouchaud - Université Paris Cité
F. Boue - inconnu
J.-P. Cabane - Sorbonne Paris Cité
A. Cabié - Centre d'Investigation Clinique Antilles Guyane
H. Champagne - Inserm
C. Cheneau
J.-M. Chennebault - Centre Hospitalier Universitaire d'Angers
A. Cheret - Université Paris Cité
B. Christian - Sorbonne Université
A. Compagnucci - Université Paris Cité
V. Daneluzzi - Centre Hospitalier Universitaire de Limoges
Y. Debab - Inserm
P. Dellamonica - Hôpital l'Archet
F. Delfraissy
A. Devidas - Université Paris Cité
G. Diab - Centre Hospitalier Universitaire de Limoges
J. Doll - Hôpital Charles-Nicolle
C. Drobacheff-Thebaut
A. Durel - Université Paris Cité
L. Esnault
L. Faba - Délégation Paris 7
E. Froguel - Inserm
D. Garipuy - Sorbonne Université
V. Garrait - Centre Hospitalier Universitaire de Limoges
L. Geffray - Inserm
C. Genet - Hôpital Universitaire Dupuytren
P. Genet - Hôpital Charles-Nicolle
L. Gérard - Inserm
J. Ghosn - Centre Hospitalier Universitaire de Montpellier
J. Girard - Université Paris Cité
Pascal Girard
C. Godin-Collet - Inserm
P. Hochedez - Hôpital Charles-Nicolle
B. Hoen - Laboratoire Chrono-Environnement
D. Houlbert - Sorbonne Université
C. Jacomet - Inserm
V. Jeantils - Hôpital Jean-Verdier
K. Jidar - Inserm
E. Klement - Inserm
A. Lafeuillade - Université Paris Cité
V. Launay - Centre Hospitalier Universitaire de Limoges
A. Leprêtre - Laboratoire d'Ecologie Numérique et d'Ecotoxicologie
Y. Levy - Institut Mondor de Recherche Biomédicale
D. Makhloufi - Sorbonne Université
D. Malbec - Sorbonne Université
B. Martha - Infectious diseases department
T. May - Bellbrook Labs
D. Merrien - Sorbonne Université
P. Miailhes - Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon
C. Miodovski - Inserm
P. Morlat - Hôpital Charles-Nicolle
E. Mortier - Unité de Biotechnologie, Biocatalyse et Biorégulation
D. Neau - Sorbonne Université
M. Obadia - Université Paris Cité
O. Patey - Université Paris Cité
L. Pellegrin - Centre d'épidémiologie et de santé publique des armées [Marseille]
V. Perronne - Centre Hospitalier Universitaire de Limoges
P. Philibert - Service de Biochimie et d'Hormonologie [CHU Montpellier]
G. Pialoux - Centre Hospitalier Universitaire de Limoges
G. Pichancourt - Centre Hospitalier Universitaire de Limoges
L. Piroth - Centre Hospitalier Universitaire Dijon Bourgogne
Y. Poinsignon - Centre de recherche en Epidémiologie et Santé des Populations
I. Poizot-Martin - Hôpital Sainte-Marguerite
T. Prazuck - Institut Pierre Louis d‘Épidémiologie et de Santé Publique
V. Prendki - Centre Hospitalier Universitaire de Limoges
F. Du Clary
D. Quinsat - Institut de Biologie et de Chimie des Protéines
A. Regnier - STMicroelectronics
J. Reynes - Institut Méditerranéen de Biodiversité et d'Ecologie Marine et Continentale
E. Rosenthal - Hôpital l'Archet
E. Rouveix - Délégation Paris 7
D. Salmon - Hôpital Edouard Herriot
F. Salanville - Hôpital Purpan
L. Schmitt
A. Simon-Coutellier - Université Paris Cité
A. Sotto - Université de Montpellier, Virulence Bacterienne et Infections Chroniques - VBIC
F. Souala - Centre Hospitalier Universitaire de Rennes
A. Stein - Université de stuttgart
F. Timsit - Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse
P. de Truchis - Hôpital Raymond-Poincaré
A. Uludag - Université Paris Cité
O. Vaillant - Université de Montpellier, Institut des Biomolécules Max Mousseron - IBMM
R. Verdon - Inserm
A. Verlesch-Langlin - Université Paris Cité
J.-P. Viard - Université Paris Cité
D. Vittecoq - Sorbonne Université
L. Weiss - Inserm
P. Yéni - Hôpital Charles-Nicolle
D. Zucman - Hôpital Foch
C. Allavena - Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Nantes]
T. Allegre - Centre Hospitalier du Pays d'Aix
I. Amri - Inserm
B. Autran - Unité de Biotechnologie, Biocatalyse et Biorégulation
C. Bacchus - Inserm
C. Blanc - Université Paris Cité
S. Bonne - Université Paris Cité
B. Bonne
S. Bouchez - Hôpital Necker-Enfants Malades
C. Charlier - Nivologie
H. Consigny
C. Duvivier - Centre d'infectiologie Necker-Pasteur [CHU Necker]
E. Fourn - Inserm
F. Guiroy - Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse
T. Huleux - Centre Hospitalier de Tourcoing
C. Katlama - Sorbonne Université
C. Lascoux - Hôpital Saint-Louis
A. Leplatois - Sorbonne Paris Cité
T. Lyavanc
J.-M. Molina - Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses
A. Naqvi - Centre Hospitalier Universitaire de Nice
G. Nembot - Centre Hospitalier Universitaire de Limoges
Y. Quertainmont - Inserm
F. Raffi - Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Nantes]
A. Samri - Inserm
L. Schneider - Inserm
S. Seang - Université Paris Cité
B. Seksik
M. Shoai-Tehrani - Inserm
L. Slama - Inserm
A. Valentin
Y. Yazdanpanah - Lille Économie Management
C. Alloui - Inserm
C. Amiel - Equipe de Recherche en Physico-Chimie et Biotechnologie
P. André - Centre d’Immunologie de Marseille-Luminy
E. André
G. Anies - Centre Hospitalier Universitaire de Limoges
F. Barin - Institut de Biologie et de Chimie des Protéines
P. Bellecave - Laboratoire de Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité
D. Bettinger - Centre Hospitalier Universitaire de Besançon
M. Bouvier-Alias - Institut Mondor de Recherche Biomédicale
F. Brun-Vézinet - Hôpital Purpan
A. Calmy - University Hospital of Geneva
V. Calvez - Pitié-Salpêtrière Hospital
W. Caveng - Sorbonne Université
A. Chaillon - Université Paris Cité
S. Chapalay - Université Paris Cité
C. Charpentier - Inserm
D. Costagliola - Université Paris Cité
J. Cottalorda - Hôpital Arnaud de Villeneuve
C. Delamare - Université Paris Cité
C. Delaugerre - Hôpital Saint-Louis
J. Dina - Hôpital Charles-Nicolle
G. Santos
V. Ferre - Centre Hospitalier Universitaire de Nantes
P. Flandre - Institut Pierre Louis d‘Épidémiologie et de Santé Publique
H. Fleury - Inserm
S. Fourati - Assistance Publique – Hôpitaux de Paris
C. Gaille - Université Paris Cité
G. Giraudeau - Centre Hospitalier Universitaire de Limoges
A. Guigon - Université Paris Cité
S. Haim-Boukobza - Université Paris Cité
E. Lagier - Université Paris Cité
H. Le Guillou-Guillemette - Centre Hospitalier Universitaire d'Angers
C. Henquell - Laboratoire Microorganismes Génome et Environnement
Jacques Izopet - Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan
Lambert Lambert-Niclot
M. Leroux - Inserm
A. Maillard - Université Paris Cité
I. Malet - Virologie
Marc Marcelin
S. Marque-Juillet - Université Paris Cité
B. Masquelier - Laboratoire de Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité
A. Mirand - Centre Hospitalier Universitaire de Clermont-Ferrand
P. Morand - Sorbonne Université
B Montes - Sorbonne Université
L. Mouna - Assistance Publique – Hôpitaux de Paris
C. Noel - Université Paris Cité
C. Pallier - Commissariat à l'Énergie Atomique et aux Énergies Alternatives
G. Peytavin - Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution
P. Pinson-Recordon - Hôpital Charles-Nicolle
J. Poveda - Université Paris Cité
S. Raymond - Université Paris Cité
S. Reigadas - Laboratoire de Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité
A. Roques - Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement
A. de Rougemont - Procédés Alimentaires et Microbiologiques
C. Roussel - Inserm
P. Schmitt
V. Schneider - Centre Hospitalier Universitaire de Limoges
E. Schvoerer - Virologie
A. Signori-Schmuck - Unit of Virus Host Cell Interactions
C. Soulié - Pitié-Salpêtrière Hospital
C. Tamalet - Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes
C. Tardy
A. Trabaud
A. Vabret - Centre Hospitalier Universitaire de Caen
S. Vallet - Laboratoire de Biodiversité et Biotechnologies Microbiennes
S. Yerly - Université Paris Cité
Publication Details: Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Vol.70(7), pp.2084-2089
Identifiers: 9937896109311
Academic Unit: Virulence Bacterienne et Infections Chroniques - VBIC; Institut des Biomolécules Max Mousseron - IBMM
Language: English
Resource Type: Journal article
Local Fields: hal-01983697