Genomics and transcriptomics of Xanthomonas campestris species challenge the concept of core type III effectome.

Brice Roux; Stéphanie Bolot; Endrick Guy; Nicolas Denancé; Martine Lautier; Marie-Françoise Jardinaud; Marion Le Saux; Perrine Portier; Marie Agnes Jacques; Lionel Gagnevin; Olivier Pruvost; Emmanuelle Lauber; Matthieu Arlat; Sebastien Carrere; Ralf Koebnik; Laurent Noel

doi:10.1186/s12864-015-2190-0

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Genomics and transcriptomics of Xanthomonas campestris species challenge the concept of core type III effectome.

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Genomics and transcriptomics of Xanthomonas campestris species challenge the concept of core type III effectome.

Brice Roux, Stéphanie Bolot, Endrick Guy, Nicolas Denancé, Martine Lautier, Marie-Françoise Jardinaud, Marion Le Saux, Perrine Portier, Marie Agnes Jacques, Lionel Gagnevin, …

BMC Genomics, Vol.16(1)

2015

DOI: https://doi.org/10.1186/s12864-015-2190-0

PMID: 26581393

Résumé

Effector

Xanthomonas outer protein

RNA sequencing

Transcriptome

Type III secretion

Xanthomonas campestris

This dataset is an important resource to mine for novel type III effector proteins as well as for bacterial genes which could contribute to pathogenicity of X. campestris.

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Détails

Titre: Genomics and transcriptomics of Xanthomonas campestris species challenge the concept of core type III effectome.
Créateurs - sans rôle: Brice Roux - Laboratoire des Interactions Plantes Micro-Organismes
Stéphanie Bolot - Centre National de la Recherche Scientifique
Endrick Guy - Laboratoire des Interactions Plantes Micro-Organismes
Nicolas Denancé - Laboratoire des Interactions Plantes Micro-Organismes
Martine Lautier - Laboratoire des Interactions Plantes Micro-Organismes
Marie-Françoise Jardinaud - Laboratoire des Interactions Plantes Micro-Organismes
Marion Le Saux - Institut de Recherche en Horticulture et Semences
Perrine Portier - Institut de Recherche en Horticulture et Semences
Marie Agnes Jacques - Institut de Recherche en Horticulture et Semences
Lionel Gagnevin - Université de Montpellier, Plant Health Institute of Montpellier - PHIM
Olivier Pruvost - Université de Montpellier, Plant Health Institute of Montpellier - PHIM
Emmanuelle Lauber - Centre National de la Recherche Scientifique
Matthieu Arlat - Université Toulouse III - Paul Sabatier
Sebastien Carrere - Centre National de la Recherche Scientifique
Ralf Koebnik - Université de Montpellier, Plant Health Institute of Montpellier - PHIM
Laurent Noel - Laboratoire des Interactions Plantes Micro-Organismes
Détails de publication: BMC Genomics, Vol.16(1)
Note de subvention: ANR Xanthomix
Identifiants: 99152634109311
Unité académique: Plant Health Institute of Montpellier - PHIM
Langue: English
Type de ressource: Journal article
Champs locaux: hal-01455988