Genomic Exploration of the Hemiascomycetous Yeasts: 18. Comparative analysis of chromosome maps and synteny with Saccharomyces cerevisiae

Bertrand Llorente; Alain Malpertuy; Cécile Neuvéglise; Jacky de Montigny; Michel Aigle; François Artiguenave; Gaëlle Blandin; Monique Bolotin-Fukuhara; Elisabeth Bon; Philippe Brottier; Serge Casaregola; Pascal Durrens; Claude Gaillardin; Andrée Lépingle; Odile Ozier-Kalogéropoulos; Serge Potier; William Saurin; Fredj Tekaia; Claire Toffano-Nioche; Micheline Wésolowski-Louvel; Patrick Wincker; Jean Weissenbach; Jean-Luc Souciet; Bernard Dujon

doi:10.1016/S0014-5793(00)02289-4

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Genomic Exploration of the Hemiascomycetous Yeasts: 18. Comparative analysis of chromosome maps and synteny with Saccharomyces cerevisiae

Article de revue

Avec comité de lecture

Genomic Exploration of the Hemiascomycetous Yeasts: 18. Comparative analysis of chromosome maps and synteny with Saccharomyces cerevisiae

Bertrand Llorente, Alain Malpertuy, Cécile Neuvéglise, Jacky de Montigny, Michel Aigle, François Artiguenave, Gaëlle Blandin, Monique Bolotin-Fukuhara, Elisabeth Bon, Philippe Brottier, …

FEBS letters, Vol.487(1), pp.101-112

22/12/2000

DOI: https://doi.org/10.1016/S0014-5793(00)02289-4

PMID: 11152893

Résumé

Deletion

Duplication

Inversion

Loss

Redundancy

Translocation

We have analyzed the evolution of chromosome maps of Hemiascomycetes by comparing gene order and orientation of the 13 yeast species partially sequenced in this program with the genome map of Saccharomyces cerevisiae. From the analysis of nearly 8000 situations in which two distinct genes having homologs in S. cerevisiae could be identified on the sequenced inserts of another yeast species, we have quantified the loss of synteny, the frequency of single gene deletion and the occurrence of gene inversion. Traces of ancestral duplications in the genome of S. cerevisiae could be identified from the comparison with the other species that do not entirely coincide with those identified from the comparison of S. cerevisiae with itself. From such duplications and from the correlation observed between gene inversion and loss of synteny, a model is proposed for the molecular evolution of Hemiascomycetes. This model, which can possibly be extended to other eukaryotes, is based on the reiteration of events of duplication of chromosome segments, creating transient merodiploids that are subsequently resolved by single gene deletion events.

Indicateurs

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Détails

Titre: Genomic Exploration of the Hemiascomycetous Yeasts: 18. Comparative analysis of chromosome maps and synteny with Saccharomyces cerevisiae
Créateurs - sans rôle: Bertrand Llorente - Institut Pasteur
Alain Malpertuy - Unité de Génétique Moléculaire des Levures (URA 2171 CNRS and UFR927 Univ. P. and M. Curie, Paris), Institut Pasteur, 25 Rue du Dr Roux, F-75724 Paris Cedex 15, France
Cécile Neuvéglise - Collection de Levures d’Intérêt Biotechnologique, Laboratoire de Génétique Moléculaire et Cellulaire (INRA UMR216, CNRS URA1925) INA-PG, P.O. Box 01, F-78850 Thiverval-Grignon, France
Jacky de Montigny - Laboratoire de Génétique et Microbiologie (UPRES-A 7010 ULP/CNRS), Institut de Botanique, 28 rue Goethe, F-67000 Strasbourg Cedex, France
Michel Aigle - Laboratoire de Biologie cellulaire de la Levure, IBGC, 1 rue Camille Saint-Säens, F-33077 Bordeaux Cedex, France
François Artiguenave - Génoscope, Centre National de Séquençage, 2 rue Gaston Crémieux, P.O. Box 191, Evry Cedex, France
Gaëlle Blandin - Institut Pasteur
Monique Bolotin-Fukuhara - Institut de Génétique Moléculaire (CNRS/UPS UMR 8621), Bâtiment 400, Université de Paris Sud, F-91405 Orsay, France
Elisabeth Bon - Collection de Levures d’Intérêt Biotechnologique, Laboratoire de Génétique Moléculaire et Cellulaire (INRA UMR216, CNRS URA1925) INA-PG, P.O. Box 01, F-78850 Thiverval-Grignon, France
Philippe Brottier - Génoscope, Centre National de Séquençage, 2 rue Gaston Crémieux, P.O. Box 191, Evry Cedex, France
Serge Casaregola - Collection de Levures d’Intérêt Biotechnologique, Laboratoire de Génétique Moléculaire et Cellulaire (INRA UMR216, CNRS URA1925) INA-PG, P.O. Box 01, F-78850 Thiverval-Grignon, France
Pascal Durrens - Laboratoire de Biologie cellulaire de la Levure, IBGC, 1 rue Camille Saint-Säens, F-33077 Bordeaux Cedex, France
Claude Gaillardin - Collection de Levures d’Intérêt Biotechnologique, Laboratoire de Génétique Moléculaire et Cellulaire (INRA UMR216, CNRS URA1925) INA-PG, P.O. Box 01, F-78850 Thiverval-Grignon, France
Andrée Lépingle - Collection de Levures d’Intérêt Biotechnologique, Laboratoire de Génétique Moléculaire et Cellulaire (INRA UMR216, CNRS URA1925) INA-PG, P.O. Box 01, F-78850 Thiverval-Grignon, France
Odile Ozier-Kalogéropoulos - Unité de Génétique Moléculaire des Levures (URA 2171 CNRS and UFR927 Univ. P. and M. Curie, Paris), Institut Pasteur, 25 Rue du Dr Roux, F-75724 Paris Cedex 15, France
Serge Potier - Laboratoire de Génétique et Microbiologie (UPRES-A 7010 ULP/CNRS), Institut de Botanique, 28 rue Goethe, F-67000 Strasbourg Cedex, France
William Saurin - Génoscope, Centre National de Séquençage, 2 rue Gaston Crémieux, P.O. Box 191, Evry Cedex, France
Fredj Tekaia - Unité de Génétique Moléculaire des Levures (URA 2171 CNRS and UFR927 Univ. P. and M. Curie, Paris), Institut Pasteur, 25 Rue du Dr Roux, F-75724 Paris Cedex 15, France
Claire Toffano-Nioche - Institut de Génétique Moléculaire (CNRS/UPS UMR 8621), Bâtiment 400, Université de Paris Sud, F-91405 Orsay, France
Micheline Wésolowski-Louvel - Microbiologie et Génétique (CNRS/UCB/INSA ERS 2009), Bâtiment 405 R2, Université Lyon I, F-69622 Villeurbanne Cedex, France
Patrick Wincker - Génoscope, Centre National de Séquençage, 2 rue Gaston Crémieux, P.O. Box 191, Evry Cedex, France
Jean Weissenbach - Génoscope, Centre National de Séquençage, 2 rue Gaston Crémieux, P.O. Box 191, Evry Cedex, France
Jean-Luc Souciet - Laboratoire de Génétique et Microbiologie (UPRES-A 7010 ULP/CNRS), Institut de Botanique, 28 rue Goethe, F-67000 Strasbourg Cedex, France
Bernard Dujon - Unité de Génétique Moléculaire des Levures (URA 2171 CNRS and UFR927 Univ. P. and M. Curie, Paris), Institut Pasteur, 25 Rue du Dr Roux, F-75724 Paris Cedex 15, France
Détails de publication: FEBS letters, Vol.487(1), pp.101-112
Éditeur: Elsevier B.V
Nombre de pages: 12
Identifiants: 99158691309311
Unité académique: Sciences pour l'oenologie - SPO
Langue: English
Type de ressource: Journal article