Genomic Exploration of the Hemiascomycetous Yeasts: 20. Evolution of gene redundancy compared to Saccharomyces cerevisiae

Bertrand Llorente; Pascal Durrens; Alain Malpertuy; Michel Aigle; François Artiguenave; Gaëlle Blandin; Monique Bolotin-Fukuhara; Elisabeth Bon; Philippe Brottier; Serge Casaregola; Bernard Dujon; Jacky de Montigny; Andrée Lépingle; Cécile Neuvéglise; Odile Ozier-Kalogeropoulos; Serge Potier; William Saurin; Fredj Tekaia; Claire Toffano-Nioche; Micheline Wésolowski-Louvel; Patrick Wincker; Jean Weissenbach; Jean-Luc Souciet; Claude Gaillardin

doi:10.1016/S0014-5793(00)02291-2

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Genomic Exploration of the Hemiascomycetous Yeasts: 20. Evolution of gene redundancy compared to Saccharomyces cerevisiae

Article de revue

Avec comité de lecture

Genomic Exploration of the Hemiascomycetous Yeasts: 20. Evolution of gene redundancy compared to Saccharomyces cerevisiae

Bertrand Llorente, Pascal Durrens, Alain Malpertuy, Michel Aigle, François Artiguenave, Gaëlle Blandin, Monique Bolotin-Fukuhara, Elisabeth Bon, Philippe Brottier, Serge Casaregola, …

FEBS letters, Vol.487(1), pp.122-133

22/12/2000

DOI: https://doi.org/10.1016/S0014-5793(00)02291-2

PMID: 11152895

Résumé

Gene deletion

Gene duplication

Genome evolution

Orthologue

Paralogue

We have evaluated the degree of gene redundancy in the nuclear genomes of 13 hemiascomycetous yeast species. Saccharomyces cerevisiae singletons and gene families appear generally conserved in these species as singletons and families of similar size, respectively. Variations of the number of homologues with respect to that expected affect from 7 to less than 24% of each genome. Since S. cerevisiae homologues represent the majority of the genes identified in the genomes studied, the overall degree of gene redundancy seems conserved across all species. This is best explained by a dynamic equilibrium resulting from numerous events of gene duplication and deletion rather than by a massive duplication event occurring in some lineages and not in others.

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Détails

Titre: Genomic Exploration of the Hemiascomycetous Yeasts: 20. Evolution of gene redundancy compared to Saccharomyces cerevisiae
Créateurs - sans rôle: Bertrand Llorente - Institut Pasteur
Pascal Durrens - Laboratoire de Biologie Cellulaire de la Levure, IBGC, 1 rue Camille Saint-Säens, F-33077 Bordeaux Cedex, France
Alain Malpertuy - Unité de Génétique Moléculaire des Levures (URA 2171 CNRS and UFR 927 Université Pierre et Marie Curie), Institut Pasteur, 25 rue du Docteur Roux, F-75724 Paris Cedex 15, France
Michel Aigle - Laboratoire de Biologie Cellulaire de la Levure, IBGC, 1 rue Camille Saint-Säens, F-33077 Bordeaux Cedex, France
François Artiguenave - Génoscope, Centre National de Séquençage, 2 rue Gaston Crémieux, BP 191, Evry Cedex, France
Gaëlle Blandin - Institut Pasteur
Monique Bolotin-Fukuhara - Université Paris-Sud
Elisabeth Bon - Laboratoire de Biologie Cellulaire de la Levure, IBGC, 1 rue Camille Saint-Säens, F-33077 Bordeaux Cedex, France
Philippe Brottier - Laboratoire de Génétique et Microbiologie, UPRES-A 7010 UPL/CNRS, Institut de Botanique, 28 rue Goethe, F-67000 Strasbourg, France
Serge Casaregola - Collection de Levures d’Intérêt Biotechnologique, Laboratoire de Génétique Moléculaire et Cellulaire, INRA UMR 216, CNRS URA 1925, INA-PG, BP01, F-78850 Thiverval-Grignon, France
Bernard Dujon - Unité de Génétique Moléculaire des Levures (URA 2171 CNRS and UFR 927 Université Pierre et Marie Curie), Institut Pasteur, 25 rue du Docteur Roux, F-75724 Paris Cedex 15, France
Jacky de Montigny - Laboratoire de Génétique et Microbiologie, UPRES-A 7010 UPL/CNRS, Institut de Botanique, 28 rue Goethe, F-67000 Strasbourg, France
Andrée Lépingle - Collection de Levures d’Intérêt Biotechnologique, Laboratoire de Génétique Moléculaire et Cellulaire, INRA UMR 216, CNRS URA 1925, INA-PG, BP01, F-78850 Thiverval-Grignon, France
Cécile Neuvéglise - Collection de Levures d’Intérêt Biotechnologique, Laboratoire de Génétique Moléculaire et Cellulaire, INRA UMR 216, CNRS URA 1925, INA-PG, BP01, F-78850 Thiverval-Grignon, France
Odile Ozier-Kalogeropoulos - Unité de Génétique Moléculaire des Levures (URA 2171 CNRS and UFR 927 Université Pierre et Marie Curie), Institut Pasteur, 25 rue du Docteur Roux, F-75724 Paris Cedex 15, France
Serge Potier - Laboratoire de Génétique et Microbiologie, UPRES-A 7010 UPL/CNRS, Institut de Botanique, 28 rue Goethe, F-67000 Strasbourg, France
William Saurin - Génoscope, Centre National de Séquençage, 2 rue Gaston Crémieux, BP 191, Evry Cedex, France
Fredj Tekaia - Unité de Génétique Moléculaire des Levures (URA 2171 CNRS and UFR 927 Université Pierre et Marie Curie), Institut Pasteur, 25 rue du Docteur Roux, F-75724 Paris Cedex 15, France
Claire Toffano-Nioche - Université Paris-Sud
Micheline Wésolowski-Louvel - Microbiologie et Génétique ERS 2009, CNRS/UCB/INSA, bat. 405 R2, Université Lyon I, F-69622 Villeurbanne Cedex, France
Patrick Wincker - Génoscope, Centre National de Séquençage, 2 rue Gaston Crémieux, BP 191, Evry Cedex, France
Jean Weissenbach - Génoscope, Centre National de Séquençage, 2 rue Gaston Crémieux, BP 191, Evry Cedex, France
Jean-Luc Souciet - Laboratoire de Génétique et Microbiologie, UPRES-A 7010 UPL/CNRS, Institut de Botanique, 28 rue Goethe, F-67000 Strasbourg, France
Claude Gaillardin - Collection de Levures d’Intérêt Biotechnologique, Laboratoire de Génétique Moléculaire et Cellulaire, INRA UMR 216, CNRS URA 1925, INA-PG, BP01, F-78850 Thiverval-Grignon, France
Détails de publication: FEBS letters, Vol.487(1), pp.122-133
Éditeur: Elsevier B.V
Nombre de pages: 12
Identifiants: 99158687409311
Unité académique: Sciences pour l'oenologie - SPO
Langue: English
Type de ressource: Journal article