Genomic Exploration of the Hemiascomycetous Yeasts: 4. The genome of Saccharomyces cerevisiae revisited

Gaëlle Blandin; Pascal Durrens; Fredj Tekaia; Michel Aigle; Monique Bolotin-Fukuhara; Elisabeth Bon; Serge Casarégola; Jacky de Montigny; Claude Gaillardin; Andrée Lépingle; Bertrand Llorente; Alain Malpertuy; Cécile Neuvéglise; Odile Ozier-Kalogeropoulos; Arnaud Perrin; Serge Potier; Jean-Luc Souciet; Emmanuel Talla; Claire Toffano-Nioche; Micheline Wésolowski-Louvel; Christian Marck; Bernard Dujon

doi:10.1016/S0014-5793(00)02275-4

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Genomic Exploration of the Hemiascomycetous Yeasts: 4. The genome of Saccharomyces cerevisiae revisited

Article de revue

Avec comité de lecture

Genomic Exploration of the Hemiascomycetous Yeasts: 4. The genome of Saccharomyces cerevisiae revisited

Gaëlle Blandin, Pascal Durrens, Fredj Tekaia, Michel Aigle, Monique Bolotin-Fukuhara, Elisabeth Bon, Serge Casarégola, Jacky de Montigny, Claude Gaillardin, Andrée Lépingle, …

FEBS letters, Vol.487(1), pp.31-36

22/12/2000

DOI: https://doi.org/10.1016/S0014-5793(00)02275-4

PMID: 11152879

Résumé

Annotation

Family

Frameshift

Intron

Pseudogene

Since its completion more than 4 years ago, the sequence of Saccharomyces cerevisiae has been extensively used and studied. The original sequence has received a few corrections, and the identification of genes has been completed, thanks in particular to transcriptome analyses and to specialized studies on introns, tRNA genes, transposons or multigene families. In order to undertake the extensive comparative sequence analysis of this program, we have entirely revisited the S. cerevisiae sequence using the same criteria for all 16 chromosomes and taking into account publicly available annotations for genes and elements that cannot be predicted. Comparison with the other yeast species of this program indicates the existence of 50 novel genes in segments previously considered as ‘intergenic’ and suggests extensions for 26 of the previously annotated genes.

Indicateurs

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Détails

Titre: Genomic Exploration of the Hemiascomycetous Yeasts: 4. The genome of Saccharomyces cerevisiae revisited
Créateurs - sans rôle: Gaëlle Blandin - Institut Pasteur
Pascal Durrens - Laboratoire de Biologie Cellulaire de la Levure, IBGC, 1 rue Camille Saint-Säens, F-33077 Bordeaux Cedex, France
Fredj Tekaia - Unité de Génétique Moléculaire des Levures (URA 2171 CNRS and UFR 927 Univ. P. M. Curie, Paris), Institut Pasteur, 25, Rue du Dr Roux, F-75724 Paris Cedex 15, France
Michel Aigle - Laboratoire de Biologie Cellulaire de la Levure, IBGC, 1 rue Camille Saint-Säens, F-33077 Bordeaux Cedex, France
Monique Bolotin-Fukuhara - Institut de Génétique Moléculaire (UMR 8621 CNRS), Bâtiment 400, Université de Paris Sud-Orsay, F-91405 Orsay Cedex, France
Elisabeth Bon - Collection de Levures d’Intérêt Biotechnologique, Laboratoire de Génétique Moléculaire et Cellulaire (INRA UMR216, CNRS URA1925), INA-PG, BP01, F-78850 Thiverval-Grignon, France
Serge Casarégola - Collection de Levures d’Intérêt Biotechnologique, Laboratoire de Génétique Moléculaire et Cellulaire (INRA UMR216, CNRS URA1925), INA-PG, BP01, F-78850 Thiverval-Grignon, France
Jacky de Montigny - Laboratoire de Génétique et Microbiologie, (UPRES-A 7010 ULP/CNRS), Institut de Botanique, 28 rue Goethe, F-67000 Strasbourg Cedex, France
Claude Gaillardin - Collection de Levures d’Intérêt Biotechnologique, Laboratoire de Génétique Moléculaire et Cellulaire (INRA UMR216, CNRS URA1925), INA-PG, BP01, F-78850 Thiverval-Grignon, France
Andrée Lépingle - Collection de Levures d’Intérêt Biotechnologique, Laboratoire de Génétique Moléculaire et Cellulaire (INRA UMR216, CNRS URA1925), INA-PG, BP01, F-78850 Thiverval-Grignon, France
Bertrand Llorente - Institut Pasteur
Alain Malpertuy - Unité de Génétique Moléculaire des Levures (URA 2171 CNRS and UFR 927 Univ. P. M. Curie, Paris), Institut Pasteur, 25, Rue du Dr Roux, F-75724 Paris Cedex 15, France
Cécile Neuvéglise - Collection de Levures d’Intérêt Biotechnologique, Laboratoire de Génétique Moléculaire et Cellulaire (INRA UMR216, CNRS URA1925), INA-PG, BP01, F-78850 Thiverval-Grignon, France
Odile Ozier-Kalogeropoulos - Unité de Génétique Moléculaire des Levures (URA 2171 CNRS and UFR 927 Univ. P. M. Curie, Paris), Institut Pasteur, 25, Rue du Dr Roux, F-75724 Paris Cedex 15, France
Arnaud Perrin - Unité de Génétique Moléculaire des Levures (URA 2171 CNRS and UFR 927 Univ. P. M. Curie, Paris), Institut Pasteur, 25, Rue du Dr Roux, F-75724 Paris Cedex 15, France
Serge Potier - Laboratoire de Génétique et Microbiologie, (UPRES-A 7010 ULP/CNRS), Institut de Botanique, 28 rue Goethe, F-67000 Strasbourg Cedex, France
Jean-Luc Souciet - Laboratoire de Génétique et Microbiologie, (UPRES-A 7010 ULP/CNRS), Institut de Botanique, 28 rue Goethe, F-67000 Strasbourg Cedex, France
Emmanuel Talla - Institut Pasteur
Claire Toffano-Nioche - Institut de Génétique Moléculaire (UMR 8621 CNRS), Bâtiment 400, Université de Paris Sud-Orsay, F-91405 Orsay Cedex, France
Micheline Wésolowski-Louvel - Microbiologie et Génétique (ERS2009 CNRS/UCB/INSA), Bâtiment 405 R2, Université Lyon I, 43 boulevard du 11 novembre 1918, F-69622 Villeurbanne Cedex, France
Christian Marck - Service de Biochimie et de Génétique moléculaire, Département de Biologie Cellulaire et Moléculaire, DSV/CEA-Saclay, F-91191 Gif-sur-Yvette, France
Bernard Dujon - Unité de Génétique Moléculaire des Levures (URA 2171 CNRS and UFR 927 Univ. P. M. Curie, Paris), Institut Pasteur, 25, Rue du Dr Roux, F-75724 Paris Cedex 15, France
Détails de publication: FEBS letters, Vol.487(1), pp.31-36
Éditeur: Elsevier B.V
Nombre de pages: 6
Identifiants: 99158587809311
Unité académique: Sciences pour l'oenologie - SPO
Langue: English
Type de ressource: Journal article