Résumé
International audience
Abstract Background Description and comparison of bacterial characteristics of ventilator-associated pneumonia (VAP) between critically ill intensive care unit (ICU) patients with COVID-19-positive, COVID + ; and non-COVID-19, COVID-. Methods Retrospective, observational, multicenter study that focused on French patients during the first wave of the pandemic (March–April 2020). Results 935 patients with identification of at least one bacteriologically proven VAP were included (including 802 COVID +). Among Gram-positive bacteria, S. aureus accounted for more than two-thirds of the bacteria involved, followed by Streptococcaceae and enterococci without difference between clinical groups regarding antibiotic resistance. Among Gram-negative bacteria, Klebsiella spp. was the most frequently observed bacterial genus in both groups, with K. oxytoca overrepresented in the COVID- group (14.3% vs . 5.3%; p < 0.05). Cotrimoxazole-resistant bacteria were over-observed in the COVID + group (18.5% vs . 6.1%; p <0.05), and after stratification for K. pneumoniae (39.6% vs . 0%; p <0.05). In contrast, overrepresentation of aminoglycoside-resistant strains was observed in the COVID- group (20% vs . 13.9%; p < 0.01). Pseudomonas sp. was more frequently isolated from COVID + VAPs (23.9% vs . 16.7%; p <0.01) but in COVID- showed more carbapenem resistance (11.1% vs . 0.8%; p <0.05) and greater resistance to at least two aminoglycosides (11.8% vs . 1.4%; p < 0.05) and to quinolones (53.6% vs . 7.0%; p <0.05). These patients were more frequently infected with multidrug-resistant bacteria than COVID + (40.1% vs . 13.8%; p < 0.01). Conclusions The present study demonstrated that the bacterial epidemiology and antibiotic resistance of VAP in COVID + is different from that of COVID- patients. These features call for further study to tailor antibiotic therapies in VAP patients.
Contexte Description et comparaison des caractéristiques bactériennes des pneumonies acquises sous ventilation mécanique (PAV) entre des patients en unité de soins intensifs (USI) gravement malades avec COVID-19 positif, COVID + ; et non COVID-19, COVID-. Méthodes Étude rétrospective, observationnelle, multicentrique, centrée sur les patients français lors de la première vague de la pandémie (mars-avril 2020). Résultats 935 patients avec identification d'au moins une PVA bactériologiquement prouvée ont été inclus (dont 802 COVID +). Parmi les bactéries à Gram positif, S. aureus représentait plus des deux tiers des bactéries impliquées, suivi des Streptococcaceae et des entérocoques sans différence entre les groupes cliniques concernant la résistance aux antibiotiques. Parmi les bactéries à Gram négatif, Klebsiella spp. était le genre bactérien le plus fréquemment observé dans les deux groupes, avec une surreprésentation de K. oxytoca dans le groupe COVID (14,3 % contre 5,3 % ; p < 0,05). Les bactéries résistantes au cotrimoxazole ont été sur-observées dans le groupe COVID + (18,5 % vs. 6,1 % ; p <0,05), et après stratification pour K. pneumoniae (39,6 % vs. 0 % ; p <0,05). En revanche, une surreprésentation des souches résistantes aux aminosides a été observée dans le groupe COVID (20 % contre 13,9 % ; p < 0,01). Pseudomonas sp. a été plus fréquemment isolé dans les PVA COVID + (23,9 % vs. 16,7 % ; p <0,01), mais dans le groupe COVID, on a observé une plus grande résistance aux carbapénèmes (11,1 % vs. 0,8 % ; p <0,05) et une plus grande résistance à au moins deux aminosides (11,8 % vs. 1,4 % ; p <0,05) et aux quinolones (53,6 % vs. 7,0 % ; p <0,05). Ces patients étaient plus fréquemment infectés par des bactéries multirésistantes que les patients COVID + (40,1 % contre 13,8 % ; p < 0,01). Conclusions La présente étude a démontré que l'épidémiologie bactérienne et la résistance aux antibiotiques de la PVA chez les patients COVID + sont différentes de celles des patients COVID. Ces caractéristiques appellent à des études plus approfondies afin d'adapter les traitements antibiotiques aux patients atteints de PVA.