Résumé
The fundamental question about Dioscorea trifida (Dioscoreaceae), the most important Amerindian yam, that remains unresolved concerns its evolutionary origin, since no wild relative has been reported. In this paper we report the existence of D. trifida's wild relative for the first time. The diploidy of wild D. trifida (2n = 40) is clearly demonstrated by flow cytometry, chromosome counts, and microsatellite pattern analysis, whereas the cultivated form was previously shown to be autotetraploid (2n = 80). In the coastal region where the wild and cultivated forms are sympatric, tetraploid and tripploid cytotypes coexist within the same populations. In the sites where the wild and cultivated forms are allopatric. the wild diploid cytotype predominates. AFLP (amplified fragment length polymorphism) analyses gave an initial idea of the position of the wild forms in relation to the cultivated forms. All the wild and cultivated types form a monophyletic group structured into two major subgroups corresponding to the tetraploid cytotype of the cultivated form and the diploid cytotype of the wild form. The triploid cytotypes of the wild form are in an intermediary position. Wild accessions are grouped on the basis of their geographic origin. The data presented in this paper are significant for the effective breeding and conservation of D. trifida and to assess its genetic diversity and population structure for the general understanding of the evolution and domestication of the species.
La question fondamentale et toujours irrésolue au sujet du Dioscorea trifida (Dioscoréacées), la plus importante espèce d’igname amérindienne, est son origine évolutive puisque aucun ancêtre sauvage ne lui est connu. Dans ce travail, les auteurs rapportent pour la première fois l’existence d’un ancêtre sauvage du D. trifida. La diploïdie du D. trifida sauvage (2n = 40) est démontrée clairement par cytométrie en flux, comptage des chromosomes et par analyse de microsatellites, tandis que la forme cultivée est connue pour être autotétraploïde (2n = 80). Dans les régions côtières où les formes sauvages et cultivées sont sympatriques, des cytotypes tétraploïdes et triploïdes sont observés au sein des mêmes populations. Dans les sites où les formes sauvages et cultivées sont allopatriques, le cytotype diploïde sauvage prédomine. Des analyses AFLP (« amplified fragment length polymorphism ») ont fourni une première indication de la position des formes sauvages par rapport aux formes cultivées. Tous les types sauvages et cultivés forment un groupe monophylétique composé de deux sous-groupes majeurs correspondant au cytotype tétraploïde de la forme cultivée et au cytotype diploïde de la forme sauvage. Les cytotypes triploïdes de la forme sauvage occupent une position intermédiaire. Les accessions sauvages sont groupées sur la base de leur origine géographique. Les données présentées ici sont significatives dans le contexte des efforts de sélection et de conservation du D. trifida ainsi que pour la mesure de la diversité génétique et de la structure de la population en vue d’une meilleure compréhension de l’évolution et de la domestication de l’espèce.