Résumé
La recherche d’évènements cellulaires rares dans un échantillon biologique présente de nombreux intérêts médicaux : dépistage de cellules fœtales dans le sang maternel ou autres tissus, évaluation du chimérisme après allogreffe, recherche de cellules pathologiques, … La rareté de ces cellules est un frein à l’utilisation de méthodes innovantes telles que le séquençage nouvelle génération et nécessite le développement de stratégies alternatives. À l’aide de la plateforme de microscopie automatisée Metafer (MetaSystem®) disponible dans notre laboratoire, nous mettons au point un système de détection d’évènements rares cytologiques ou cytogénétiques sur échantillons humains.
Différentes matrices biologiques sont testées : cellules sanguines circulantes, biopsies d’organes lymphoïdes secondaires, frottis cervicovaginaux. Un étalon interne positif est ajouté à chaque type de prélèvement dont la quantité est contrôlée par comptage au microscope optique. Ces étalons internes sont sélectionnés en fonction de leurs propriétés cytologiques (présence d’un antigène de surface) et/ou cytogénétiques (sexe chromosomique). Les paramètres du logiciel de détection (« classifiers ») sont adaptés aux caractéristiques des cellules à identifier sur plusieurs cycles de détection/analyse.
Les premiers tests réalisés sur ces 3 matrices révèlent des caractéristiques analytiques satisfaisantes : limite de détection, corrélation entre le nombre d’évènements détectés et le nombre attendu, rapidité d’acquisition/interprétation. À ce jour, ces tests nécessitent d’être validés sur des séries plus importantes.
Cette approche automatisée par microscopie est un outil fiable et robuste. Elle permettra de détecter des mosaïcismes ou des chimérismes très faibles qui échappent aux technologies de nouvelle génération.