Résumé
We report here an analysis of the structure of genetic diversity in cultivated sorghums. A core collection of 210 landraces representative of race, latitude of origin, response to day length, and production system was analysed with 74 RFLP probes dispersed throughout the genome. Multivariate analyses showed the specificity of the subrace guinea margaritiferum, as well as the geographical and racial pattern of genetic diversity. Neighbour-joining analysis revealed a clear differentiation between northern and southern equatorial African accessions. The presence of Asian accessions in these 2 major geographical poles for sorghum evolution indicated two introductions of sorghum into Asia. Morphological race also influenced the pattern of sorghum genetic diversity. A single predominant race was identified in 8 of 10 clusters of accessions, i.e., 1 kafir, 1 durra, 4 guinea, and 2 caudatum clusters. Guinea sorghums, with the exception of accessions in the margaritiferum subrace, clustered in 3 geographical groups, i.e., western African, southern African, and Asian guinea clusters; the latter two appeared more closely related. Caudatum were mainly distributed in 2 clusters, the African Great Lakes caudatum cluster and those African caudatum originating from other African regions. This last differentiation appears related to contrasting photoperiod responses. These results aid in the optimization of sampling accessions for introgression in breeding programs
Une analyse approfondie de la structuration de la diversité génétique des sorghos cultivés est présentée. Une core collection de 210 variétés représentatives de la diversité des races, latitudes, réponses à la durée du jour et systèmes de culture a été analysée au moyen de 74 sondes PLFR réparties sur le génome. Les analyses multivariées ont montré la spécificité des guinea margaritiferum ainsi qu’une structuration géographique et raciale de la diversité génétique. L’analyse « neighbour joining » a montré une différenciation entre variétés africaines du nord et du sud de l’équateur. La présence de variétés asiatiques dans chacun de ces grands pôles géographiques d’évolution des sorghos indique 2 introductions en Asie. La race est aussi un des facteurs impliqués dans la structuration de la diversité génétique des sorghos. Parmi les 10 groupes de variétés identifiés, 8 groupes sont constitués majoritairement d’accessions appartenant à la même race, soit 1 groupe de kafir, 1 de durra, 4 groupes de guinea et 2 groupes de caudatum. Les sorghos guinea, à l’exception des guinea margaritiferum, se répartissent dans trois groupes géographiques, guinea d’Afrique de l’ouest, d’Afrique Australe et d’Asie, les 2 derniers étant les plus proches génétiquement. Les caudatum sont principalement répartis dans 2 groupes, le groupe des variétés originaires de la région des grands lacs d’Afrique et celui constitué par les autres caudatum africains. Cette dernière différenciation apparaît liée à des différences de comportements vis-à-vis de la photopériode. Ces résultats permettent d’optimiser le choix des variétés à utiliser dans un programme de sélection.