Résumé
Les conflits génomiques apparaissent lorsque différents compartiments du génome sont soumis à des pressions de sélection favorisant des effets opposés sur un phénotype. L’origine de ces conflits provient d’éléments génétiques égoïstes employant diverses stratégies pour maximiser leur transmission à la génération suivante. Ainsi, des résistances ou des suppresseurs peuvent évoluer, contre-sélectionnant un variant égoïste et empêchant sa fixation. La stérilité mâle cytoplasmique (SMC) chez les plantes est un exemple bien connu de conflits dans lequel les gènes transmis par la mère suppriment la fonction mâle des hermaphrodites, et des gènes nucléaires appelés restaurateurs de la fertilité mâle, évoluent pour contrer les effets de la SMC.La SMC a été longtemps recherchée chez les animaux, sans succès. Cependant, elle a été récemment reportée chez Physa acuta, un escargot d'eau douce. Chez cette espèce, le génome mitochondrial associé à de la SMC présente une divergence moléculaire extrême par rapport aux cytotypes normaux (N) et ce au niveau de tous les gènes mitochondriaux. Toutefois, aucune preuve de restauration nucléaire n’a été découverte jusqu’à présent. Cet escargot facile d’élevage a un temps de génération court et offre donc une occasion unique d’évaluer les concepts développés chez les plantes.L’objectif de cette thèse était d’étudier un conflit nucléo-cytoplasmique au travers de la SMC chez P. acuta. Par ces travaux, j’ai montré l’existence d’un nouveau génome mitochondrial divergent associé à de la SMC ainsi que l’existence d’un polymorphisme nucléaire contribuant à la restauration de la fonction mâle. La mise en évidence de restaurateurs m’a permis d’explorer les trajectoires évolutives prédites par les modèles de maintien du polymorphisme chez les plantes grâce à 11 générations d’évolution expérimentale. Ces résultats ont montré une sélection fréquence-dépendante des restaurateurs et une contre-sélection de la SMC dans un contexte où les restaurateurs sont abondants. J’ai également constaté que le potentiel de restauration est spécifique d’un type de SMC et que son déterminisme génétique est complexe. Enfin, à l’aide d’une approche de scan génomique j’ai souhaité explorer les conséquences génomiques de la restauration et de la SMC en population naturelle. Mes travaux ont permis pour la première fois de suivre en temps réel l'interaction entre un variant mitochondrial égoïste et leur résistance.