Résumé
L'épissage alternatif est un mécanisme important et lié à la complexité de notre génome, il est impliqué dans de nombreux processus biologiques et maladies. Durant ces dernières années, la chromatine a été montrée comme jouant un rôle majeur dans la régulation de l'épissage. Cependant, à quel point les modifications d'histones peuvent impacter ce phénomène reste encore inconnu. Pour répondre à cette question, nous utilisons comme modèle la transition épithélio-mésenchymateuse (TEM), un système dynamique et inductible de reprogrammation cellulaire, dans lequel l'épissage est fortement impliqué.Nous avons premièrement corrélé les changements d'épissage alternatif et les changements d'enrichissements de marques d'histones le long de gènes essentiels pour la TEM tels que FGFR2 et CTNND1. Étonnamment, nous observons des changements très précoces de certaines marques (H3K27me3, H3K27Ac), qui précèdent les changements d'épissage alternatif, alors que d'autres vont être plus tardives (H3K4me1) et être associées à des changements d'épissage déjà établis. Pour répondre à la question d'un potentiel effet direct des marques d'histones sur l'épissage, nous avons adapté le système CRISPR/dCas9 afin de modifier les niveaux de H3K27me3 et H3K27Ac spécifiquement sur les exons alternativement épissés et de voir l'effet sur l'inclusion de ceux-ci. Pour la première fois, nous avons pu induire un changement d'épissage par la simple modification de marques d'histones spécifiquement sur l'exon alternativement épissé, prouvant que ces marques sont suffisantes pour induire les changements dynamiques d'épissage observés durant la TEM. Ces changements d’épissage liés à la chromatine se sont également montrés suffisants pour induire une TEM partielle, suggérant un rôle physiologique de ces marques d’histones dans la régulation de l’épissage alternatif.Ensemble, nos résultats démontrent un nouveau rôle de la chromatine dans la régulation de l'épissage alternatif au cours du processus de reprogrammation cellulaire qu’est la TEM, et qu'un changement spécifique des marques sur l'exon régulé est suffisant pour induire le changement d'épissage. Ces modifications étant suffisantes pour induire des changements d’épissage qui vont à leur tour avoir des conséquences phénotypiques sur l’identité des cellules.