Résumé
Bien que la séquence Eviter-Réduire-Compenser (ERC) soit utilisée de manière croissante depuis 2010, son efficacité reste controversée et des travaux récents pointent la rareté d'études quantitatives visant à évaluer l'efficacité de cette politique publique. Le manque de retours, notamment sur l'efficacité des compensations écologiques, est un frein majeur à la compréhension du système compensatoire en tant que moyen de conservation de la biodiversité. Cette thèse a eu pour objectif de quantifier et caractériser l'efficacité d'un programme de compensation de grands projets d'infrastructure. Elle a également eu pour objectif de porter un regard critique sur les méthodes de suivis, dont les faiblesses dans leurs conceptions et les freins opérationnels sont des causes majeures du manque de connaissances écologiques de l'efficacité du système compensatoire. Le cas d'étude utilisé pour la thèse est la Ligne à Grande Vitesse « Contournement Nîmes-Montpellier » (LGV CNM), qui a été construite à partir de 2013 et mise en service depuis 2017. Cette LGV traverse une grande partie de la ZPS des Costières Nîmoises qui est constituée majoritairement d'une mosaïque de parcelles agricoles et qui héberge de nombreuses espèces protégées.Pour les populations de deux espèces, l'outarde canepetière (Tetrax tetrax) et l'œdicnème criard (Burhinus oedicnemus), des méthodologies robustes de type Before-During-After-Control-Impact (BDACI) ont été utilisées. Les suivis mis en place depuis 2010 ont permis d'étudier d'une part les impacts de la LGV sur les populations, et d'autre part l'effet des mesures compensatoires. Les analyses ont montré que l'objectif de « non perte nette de biodiversité » n'a pas été atteint pour ces deux populations. Concernant les outardes canepetières mâles, seulement 30% des effectifs perdus dans la zone d'effet de la LGV ont pu être récupérés par la surface compensatoire. Pour les œdicnèmes criards, les effectifs perdus dans la zone d'effet de la LGV n'ont pas été récupérés par ces mesures.Les suivis ont également permis d'appréhender les facteurs de succès ou d'échecs de mesures compensatoires. Nous avons testé l'effets de facteurs pouvant guider le choix des parcelles, comme le type de milieux déjà présent avant gestion et l‘insertion paysagère d'une parcelle. Nous avons aussi exploré l'effet de variables socio-économiques associés aux agriculteurs et agricultrices engagés dans le programme de compensation afin de comprendre certains mécanismes expliquant l'efficacité de la compensation. Pour les œdicnèmes criards, des protocoles spécifiques et la pose de balises GPS ont aussi permis d'améliorer les connaissances sur l'écologie locale de l'espèce. Les résultats ont ainsi permis d'éclairer ceux issus du suivi de l'efficacité de la compensation et de définir de nouvelles préconisations de mesures.Des suivis spécifiques ont été mis en place afin d'étudier l'efficacité de la compensation pour d'autres espèces. Il s'agit des lézards ocellés (Timon lepidus), orthoptères dont la magicienne dentelée (Saga pedo), proserpines (Zerynthia rumina) et dianes (Zerynthia polyxena). Pour ces espèces l'analyse des données s'est associée à une réflexion critique de la conceptualisation des suivis et des écueils observés lors de la phase d'application. Cette analyse critique a conduit à la mise en place de recommandations méthodologiques et d'une grille d'évaluation des suivis, afin d'améliorer leur capacité à fournir des résultats exploitables pour améliorer les pratiques de conservation.Cette thèse alimente ainsi la compréhension du système de compensation en fournissant un rare retour sur l'efficacité de compensation de populations. Dans un cadre de réflexion entre conditions théoriques et freins opérationnels, cette thèse permet également de fournir des recommandations à la fois pour la mise en place d'actions de gestion et pour le suivi des programmes compensatoires