Résumé
La réponse immunitaire adaptative est apparue chez les vertébrés à mâchoires. Elle se caractérise par une grande spécificité et une extrême diversité de récepteurs d'antigènes, les immunoglobulines ou anticorps -IG- et les récepteurs des cellules T -TR-, exprimés sur les lymphocytes B et les lymphocytes T, respectivement. Cette réponse se distingue par sa mémoire immunologique. Plusieurs mécanismes complexes et uniques, et quatre types de gènes contribuent à la synthèse des chaînes IG et TR. Ces gènes, fortement polymorphiques, se répartissent en sept loci (IGH, IGK, IGL, TRA, TRB, TRG et TRD), et ont une structure très complexe qui ne peut être analysée correctement avec les logiciels d'annotation classiques. IMGT®, le système d'information international ImMunoGeneTics®, est la référence internationale en immunogénétique et immuno-informatique, spécialisée dans les IG et les TR.Avec l'avènement du séquençage haut-débit, des séquences d'ADN complètes de génomes sont générées. Mon projet de thèse doctorale correspond à l'exploration des loci IG et TR du Gorilla gorilla gorilla, deuxième primate le plus proche de l'homme, en vue de décryptage des ces loci et leur interprétation selon les standards IMGT®. A partir des assemblages des séquençages disponibles sur le portail National Center of Biotechnology Information -NCBI-, nous avons sélectionné les génomes de trois individus du gorille, Kamilah_GGO_v0, Susie3 et KB3781, et nous avons caractérisé les gènes et les allèles en fonction des axiomes d'IMGT-ONTOLOGY et des règles de la Charte Scientifique IMGT®. Ceux-ci, nous ont permis de générer des répertoires de références IG et TR du premier axe de recherche IMGT, pour des analyses génomiques comparatives intra espèce, et avec l'homme et d'autres primates. Nous avons identifié de nombreux gènes orthologues, ainsi que des variations génomiques entre les individus, qui vont contribuer à mieux comprendre la réponse immunitaire adaptative et son évolution.