Résumé
La diversité des espèces vivantes sur Terre n'est pas répartie équitablement dans l'espace, le temps, et entre lignées. L’origine de cette disparité est un questionnement phare des études macroévolutives. La grande diversité des insectes, en particulier, pose la question du rôle des facteurs biotiques et des innovations clefs tel que le contournement de défense des plantes dans la diversification des organismes. Bien que cela constitue l'une des théories principales de la diversification des insectes phytophages, de nombreux facteurs climatiques, morphologiques, ou contingents pourraient également avoir été des acteurs majeurs dans leur histoire évolutive. Pour explorer ces questions, il est nécessaire de se placer dans un cadre phylogénétique robuste et bien échantillonné, ce qui peut représenter un défi important pour des organismes non-modèles. Dans cette thèse, je traite cette question en reconstruisant les phylogénies quasi exhaustives, robustes et datées de deux tribus de la famille des Papilionidae, des papillons charismatiques à la répartition mondiale. A l'aide d'approches génomiques de délimitation d'espèces à l'échelle populationnelle, de productions de génomes complets et de génomes de référence, ainsi que des études phylogénomiques poussées, je révise la taxonomie des deux groupes, et infère leur histoire évolutive d’un point de vue biotique (plante hôte) et biogéographique. Cette étude comparative représente une avancée majeure pour la compréhension de l’histoire évolutive de la famille des Papilionidae, et souligne l'importance d’un échantillonnage exhaustif pour appréhender précisément les facteurs de leur diversification.