Data from: The banana (Musa acuminata) genome and the evolution of monocotyledonous plants

Angelique D'Hont; France Denoeud; Jean-Marc Aury; Franc-Christophe Baurens; Françoise Carreel; Olivier Garsmeur; Benjamin Noel; Stéphanie Bocs; Gaëtan Droc; Mathieu Rouard; Corinne Da Silva; Jabbari Kamel; Céline Cardi; Julie Poulain; Marlène Souquet; Karine Labadie; Cyril Jourda; Juliette Lengellé; Marguerite Rodier-Goud; Adriana Alberti; Maria Bernard; Margot Correa; Saravanaraj Ayyampalayam; Michael R. McKain; Jim Leebens-Mack; Diane Burgess; Mike Freeling; Didier Mbéguié- A-Mbéguié; Matthieu Chabannes; Thomas Wicker; Olivier Panaud; Jose Barbosa; Eva Hribova; Pat Heslop-Harrison; Rémy Habas; Ronan Rivallan; Philippe Francois; Claire Poiron; Andrzej Kilian; Dheema Burthia; Christophe Jenny; Frédéric Bakry; Spencer Brown; Valentin Guignon; Gert Kema; Miguel Dita; Cees Waalwijk; Steeve Joseph; Anne Dievart; Olivier Jaillon; Julie Leclercq; Xavier Argout; Eric Lyons; Ana Almeida; Mouna Jeridi; Jaroslav Dolezel; Nicolas Roux; Ange-Marie Risterucci; Jean Weissenbach; Manuel Ruiz; Jean-Christophe Glaszmann; Francis Quétier; Nabila Yahiaoui; Patrick Wincker

doi:10.5061/dryad.mm54f

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Data from: The banana (Musa acuminata) genome and the evolution of monocotyledonous plants

Angelique D'Hont, France Denoeud, Jean-Marc Aury, Franc-Christophe Baurens, Françoise Carreel, Olivier Garsmeur, Benjamin Noel, Stéphanie Bocs, Gaëtan Droc, Mathieu Rouard, …

Dryad

05/02/2013

DOI: https://doi.org/10.5061/dryad.mm54f

Résumé

banana

Musa acuminata

Bananas (Musa spp.), including dessert and cooking types, are giant perennial monocotyledonous herbs of the order Zingiberales, a sister group to the well-studied Poales, which include cereals. Bananas are vital for food security in many tropical and subtropical countries and the most popular fruit in industrialized countries1. The Musa domestication process started some 7,000 years ago in Southeast Asia. It involved hybridizations between diverse species and subspecies, fostered by human migrations2, and selection of diploid and triploid seedless, parthenocarpic hybrids thereafter widely dispersed by vegetative propagation. Half of the current production relies on somaclones derived from a single triploid genotype (Cavendish)1. Pests and diseases have gradually become adapted, representing an imminent danger for global banana production3, 4. Here we describe the draft sequence of the 523-megabase genome of a Musa acuminata doubled-haploid genotype, providing a crucial stepping-stone for genetic improvement of banana. We detected three rounds of whole-genome duplications in the Musa lineage, independently of those previously described in the Poales lineage and the one we detected in the Arecales lineage. This first monocotyledon high-continuity whole-genome sequence reported outside Poales represents an essential bridge for comparative genome analysis in plants. As such, it clarifies commelinid-monocotyledon phylogenetic relationships, reveals Poaceae-specific features and has led to the discovery of conserved non-coding sequences predating monocotyledon–eudicotyledon divergence.

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Détails

Titre: Data from: The banana (Musa acuminata) genome and the evolution of monocotyledonous plants
Créateurs - sans rôle: Angelique D'Hont
France Denoeud - Genoscope
Jean-Marc Aury - Genoscope
Franc-Christophe Baurens - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Françoise Carreel - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Olivier Garsmeur - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Benjamin Noel - Genoscope
Stéphanie Bocs - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Gaëtan Droc - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Mathieu Rouard - Bioversity International, Parc Scientifique Agropolis II, 34397 Montpellier Cedex 5, France
Corinne Da Silva - Genoscope
Jabbari Kamel - Genoscope
Céline Cardi - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Julie Poulain - Genoscope
Marlène Souquet - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Karine Labadie - Genoscope
Cyril Jourda - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Juliette Lengellé - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Marguerite Rodier-Goud - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Adriana Alberti - Genoscope
Maria Bernard - Genoscope
Margot Correa - Genoscope
Saravanaraj Ayyampalayam - University of Georgia
Michael R. McKain - University of Georgia
Jim Leebens-Mack - University of Georgia
Diane Burgess - University of California, Berkeley
Mike Freeling - University of California, Berkeley
Didier Mbéguié- A-Mbéguié - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Matthieu Chabannes - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Thomas Wicker - University of Zurich
Olivier Panaud - Centre National de la Recherche Scientifique
Jose Barbosa - Centre National de la Recherche Scientifique
Eva Hribova - Czech Academy of Sciences, Institute of Experimental Botany
Pat Heslop-Harrison - University of Leicester
Rémy Habas - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Ronan Rivallan - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Philippe Francois - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Claire Poiron - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Andrzej Kilian - ACT Government
Dheema Burthia - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Christophe Jenny - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Frédéric Bakry - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Spencer Brown - Centre National de la Recherche Scientifique
Valentin Guignon - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Gert Kema - University of Wageningen, Plant Research International, 6700 AA Wageningen. Netherlands
Miguel Dita - Brazilian Agricultural Research Corporation
Cees Waalwijk - University of Wageningen, Plant Research International, 6700 AA Wageningen. Netherlands
Steeve Joseph - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Anne Dievart - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Olivier Jaillon - Genoscope
Julie Leclercq - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Xavier Argout - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Eric Lyons - University of Arizona
Ana Almeida - University of California, Berkeley
Mouna Jeridi - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Jaroslav Dolezel - Czech Academy of Sciences, Institute of Experimental Botany
Nicolas Roux - Bioversity International, Parc Scientifique Agropolis II, 34397 Montpellier Cedex 5, France
Ange-Marie Risterucci - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Jean Weissenbach - Genoscope
Manuel Ruiz - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Jean-Christophe Glaszmann - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Francis Quétier - Université d'Évry Val-d'Essonne
Nabila Yahiaoui - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Patrick Wincker - Genoscope
Éditeur: Dryad
Identifiants: 99163701509311
Unité académique: Institut Amélioration Génétique & Adaptation des Plantes méditerranéennes & tropicales-AGAP
Langue: English
Type de ressource: Dataset