Résumé
La recherche des traits impliqués dans la virulence et adaptatifs pour un hôte ou son parasite, l’étude des compromis entre ces traits et des bases génétiques de ces traits, sont cruciales pour la compréhension de l’évolution de la virulence. Dans les pathosystèmes cultivés, la virulence (classiquement définie comme la baisse de fitness infligée à l’hôte par son parasite) est remplacée par la notion de pouvoir pathogène défini comme la quantité de dommages infligée à l’hôte. Une partie du pouvoir pathogène dépend d’interactions spécifiques qualitatives de type gène pour gène prenant de facto en compte la variabilité des génotypes hôtes et parasites. Par contre, très peu de travaux intégrant les interactions génotype X génotype (G X G) ont porté sur l’agressivité, composante qualitative du pouvoir pathogène, qui correspond à la réponse du parasite aux résistances partielles des hôtes. Nous étudions l’adaptation du pathogène fongique modèle Magnaporthe oryzae aux résistances partielles du riz. Nous avons recherché des traits adaptatifs impliqués dans l’agressivité en prenant en compte les interactions G X G, étudié les corrélations entre traits, et recherché leurs bases génétiques. Nous avons d’abord testé 18 isolats de M. oryzae représentatifs de la diversité génétique mondiale sur une variété de riz très sensible. Le nombre de lésions par feuille, la taille des lésions, le nombre de spores par unité de surface de lésion ont été mesurés. Les résultats ont montré des différences significatives entre souches pour les 3 traits évalués. Ces données nous donnent accès à l’héritabilité des caractères mesurés. Nous avons ensuite testé 4 des 18 isolats précédents sur 4 variétés de riz de niveaux de résistance variables et mesuré les mêmes caractères. Nous avons détecté des variations significatives entre souches pour tous les facteurs mesurés, ainsi que des interactions G X G. Des essais préliminaires ont également été réalisés sur la capacité de transmission à des plantes saines. Enfin, un croisement sexué a été réalisé entre les 2 souches ayant des positions extrêmes dans les gammes de variation des traits. Deux cents descendants ont été générés, et génotypés avec 35 marqueurs microsatellites. Cette carte sera complétée par 300 marqueurs développés à partir des génomes complets des 2 parents, qui seront acquis courant 2010. Cette densité devrait permettre de cartographier finement les QTL sous-tendant les traits impliqués dans l’adaptation aux résistances partielles.