Résumé
La biologie est un domaine connu pour sa production massive de données. Ces données sont souvent qualifiées d'hétérogènes et de fragmentées, et les biologistes ne disposent pas d'une représentation formelle, qui, à l'échelle de l'organisme, permettrait de les représenter et de les organiser. Depuis une dizaine d'années les modèles mathématiques systémiques se sont révélés être des outils utiles pour comprendre le comportement de la cellule. Nous montrons dans ce travail qu'une ontologie construite sur les principes qui régissent la conception de ces modèles peut aider à organiser les données biologiques. Nous présentons ici un choix de concepts et relations compatibles avec les principes à l'oeuvre dans les modèles systémiques.