Résumé
IntroductionLa surveillance épidémiologique des maladies infectieuses peut utiliser les eaux usées pour détecter des marqueurs d’agents pathogènes et ainsi évaluer leur diffusion dans la population. Cette méthode donne un signal épidémiologique qui évite certains biais de la surveillance clinico-biologique, comme le faible taux de dépistage ou la présence d’asymptomatiques dans une population. Son utilisation s’est largement développée lors de la pandémie COVID-19. On peut citer par exemple le réseau Obépine qui a permis de centraliser la surveillance en France. Cette étude montre i) la mise en place une surveillance continue de 5 virus à tropisme digestif ou non dans les eaux usées d’une métropole, ii) les résultats d’une année de surveillance.Matériels et MéthodesLes virus SARS-CoV-2, Influenza A, virus des hépatites A et E et norovirus génogroupes I et II sont surveillés de façon hebdomadaire dans les eaux usées d’entrée de la station d’épuration de Montpellier depuis février 2023. Le nombre de copies d’acide nucléiques viraux est quantifié par digital RT-PCR puis comparées avec les données clinico-biologiques locales : résultats des tests virologiques et l’occupation des lits par des patients SARS-CoV-2positifs au CHU de Montpellier, ainsi que des indicateurs de santé publique de l’Hérault et de la région Occitanie. Les paramètres propres au réseau d’assainissement, tels que les rejets industriels, les temps de séjour, la pluviométrie et les indicateurs physico-chimiques sont recueillis.Résultats et DiscussionL’analyse d’un an de données met en évidence la dynamique temporelle des virus suivis. Des épidémies saisonnières de norovirus, Influenza A et SARS-CoV-2 sont observées et leur corrélation avec les indicateurs de santé publique est analysée. Des signaux ponctuels sont observés pour les virus des hépatites : i) rares et dissociés des indicateurs cliniques; ii) étonnamment fréquents mais non saisonniers pour l’hépatite E. Après les premier succès la surveillance du COVID-19 via les eaux usées, cette première étude de la dynamique hebdomadaire de 5 virus sur une année montre la faisabilité de l’approche et l’importance d’intégrer la surveillance des eaux usées dans les modèles épidémiologiques.