Résumé
Les virus de la grippe A saisonnière (IAV) représentent une menace mondiale globale, qui peut se traduire par une saturation des systèmes de santé et entrainent tous les ans une morbidité et une mortalité importante des patients atteints.Les protéines antivirales induites par l’interféron représentent l’une des premières lignes de défense contre ces virus. Nous avons démontré précédemment que, parmi ces protéines, l’isoforme courte du coactivateur du récepteur nucléaire 7 (NCOA7-AS) permet d’inhiber l’entrée du virus IAV dans les cellules cibles (Doyle et al, Nat Microb 2018). La surexpression de NCOA7-AS entraine une diminution de la fusion entre l’enveloppe lipidique de l’IAV et la membrane endolysosomale. Cette inhibition de l’entrée virale est corrélée à une augmentation de l’acidification des endolysosomes observée en présence de NCOA7-AS, qui pourrait être due à l’interaction de NCOA7-AS avec la v-ATPase, modifiant ainsi son activité par un mécanisme non élucidé. Afin de mieux comprendre le mécanisme d’action moléculaire de NCOA7-AS, nous avons identifié ses partenaires protéiques par spectrométrie de masse. Nous avons ainsi confirmé son interaction avec plusieurs sous-unités de la v-ATPase et avons montré que la Glycine 91 de NCOA7-AS est essentielle pour son interaction avec la v-ATPase et son activité antivirale. De plus, nous avons identifié les protéines Sorting Nexin BAR SNX 1/2/5/6 comme de nouveaux partenaires protéiques de NCOA7-AS. Ces SNX sont impliquées dans le transport rétrograde de protéines cargos cellulaires de la voie endolysosomale vers le réseau trans-golgien. Par des approches d’ARN interférence, nous avons montré que les SNX5/6 sont essentielles pour la régulation du pH endolysosomal par NCOA7-AS et pour son activité antivirale. L’obtention de la structure tridimensionnelle du complexe SNX5-NCOA7-AS par cristallographie aux rayons X a permis d’identifier les résidus majeurs impliqués dans l’interaction entre ces 2 protéines, à savoir la phénylalanine 136 de la SNX5 et la tyrosine 14 de NCOA7-AS. La mutation de la tyrosine 14 de NCOA7-AS abolit son activité antivirale, confirmant ainsi que l’interaction avec la SNX5 est essentielle pour sa fonction. En conclusion, cette étude identifie de nouveaux acteurs impliqués dans l’activité antivirale de NCOA7-AS : les sorting nexins 5 et 6. De futures expériences permettront de déterminer quel est leur rôle exact dans la régulation de l’activité de la v-ATPase.Doyle T, Moncorgé O, Bonaventure B, Pollpeter D, Lussignol M, Tauziet M, Apolonia L, Catanese MT, Goujon C, Malim MH. The interferon-inducible isoform of NCOA7 inhibits endosome-mediated viral entry. Nat Microbiol. 2018 Dec;3(12):1369-1376