Résumé
Spodoptera frugiperda est un lépidoptère ravageur de culture dont la chenille dévore principalement les grandes cultures de maïs. Dans le cadre de la lutte biologique contre ces ravageurs, plusieurs microorganismes pathogènes peuvent être utilisés comme alternative aux pesticides. Le laboratoire DGIMI étudie trois pathogènes capables de tuer les chenilles de Spodoptera. Le complexe némato-bactérien (CNB) Steinernema carpocapsae/Xenorhabdus nematophila est capable de pénétrer dans l'hémolymphe des insectes qu'il contamine de ses bactéries symbiotiques, tuant l'insecte en quelques heures. La guêpe parasitoïde Hyposoter didymator, pour se reproduire, pond un oeuf dans une chenille. Elle co-injecte à ce moment-là un virus (HdIV) dont le génome est intégré au sien et qui est nécessaire au succès parasitaire de la guêpe, notamment en abolissant la réponse immunitaire de la chenille. Finalement, le virus JcDV est un petit virus à ADN spécifique d'insecte qui, lorsqu'il est ingéré par la chenille, traverse la barrière intestinale pour infecter ses tissus cibles et provoquer la mort de l'insecte. Dans ces trois modèles d'infection, nous avons étudié par RNA-seq la réponse transcriptionnelle tissu-spécifique de la chenille face à ses pathogènes, en regardant particulièrement les gènes de l'immunité. Nous avons vu que la chenille est capable de déployer l'ensemble de son arsenal anti-microbien en réponse au CNB ainsi qu'au HdIV, mais pas contre le virus JcDV qui semble passer inaperçu. Cette étude nous a permis de décrire les spécificités du système immunitaire lépidoptère face à différents micro-organismes ainsi que de découvrir de nouveaux peptides anti-microbiens acquis par transfert horizontal de gènes.