Résumé
L'albicidine est une molécule à activité phytotoxique et antibiotique produite par la bactérie Xanthomonas albilineans, l'agent causal de la maladie de l'échaudure des feuilles de la canne à sucre. L'albicidine, qui est un composant-clé de la pathogénie de X. albilineans, est synthétisée par un système hybride PKS/NRPS («PolyKetide Synthase/NonRibosomal Peptide Synthetase»). Il s'agit d'un puissant inhibiteur de l'ADN gyrase de plantes et de bactéries. Son mode d'action est original car, au contraire de celui d'autres antibiotiques connus, l'albicidine bloque la partie C-terminale du site de fixation à l'ADN de la gyrase A. La caractérisation de l'albicidine a jusqu'à présent été ralentie à cause des faibles rendements de production de cette molécule par X. albilineans. C'est pourquoi, l'ensemble des gènes nécessaires à la biosynthèse de l'albicidine ont été transférés dans la bactérie à croissance rapide X. axonopodis pv. vesicatoria. Ce transfert de gènes a conduit à une production d'albicidine beaucoup plus élevée. Une combinaison de méthodes biochimiques et chromatographiques a permis la purification de l'albicidine. De plus, plusieurs techniques de spectrométrie de masse (ESI-MALDI-TOF, FTICR-MS) ont permis (i) de déterminer la masse exacte de l'albicidine (842.2 Da) et (ii) de proposer un nombre limité de formules chimiques compatibles avec la masse de la molécule. Enfin, plusieurs caractéristiques chimiques de l'albicidine ont pu être déterminées grâce à des analyses préliminaires en RMN. En conclusion, l'augmentation des rendements de production de l'albicidine en système hétérologue, conjuguée à une plus grande efficacité de sa purification, ont permis de réaliser des progrès dans la caractérisation structurale de l'albicidine. De plus grandes quantités d'albicidine purifiée sont en cours de préparation et celles-ci seront prochainement analysées grâce à des techniques de caractérisation structurale performantes. (Texte intégral)