Résumé
L’anaplasmose granulocytaire est une zoonose émergente transmise par les tiques, due à la bactérie Anaplasma phagocytophilum. Elle infecte de nombreux mammifères. Les chevreuils, et dans une moindre mesure les rongeurs, sont suspectés d’être des hôtes réservoirs (pouvant être la source d’infection pour les bovins via les tiques), du fait de forte prévalence dans leurs populations. Notre étude vise à caractériser génétiquement les souches d’A. phagocytophilum sur 9 loci chez 120 animaux domestiques malades provenant de toute la France ainsi que des chevreuils, pour mieux comprendre l’implication de chaque espèce hôte dans la circulation des souches. Cette caractérisation génétique nous a permis d’identifier 3 groupes de souches infectant les bovins. Les deux principaux groupes incluent 98 % des souches trouvées chez les bovins et sont génétiquement différentes de celles observées chez les chevreuils. Nos résultats suggèrent que les souches d’A. phagocytophilum infectant les bovins pourraient avoir plusieurs sources, différentes de celle du chevreuil