Résumé
Xanthomonas albilineans est l'agent causal de "échaudure des feuilles, une des principales maladies bactériennes de la canne à sucre. L'étude de son génome a permis de confirmer que X albilineans est une bactérie originale au regard des autres espèces de Xanthomonas . En effet, elle ne possède ni les gènes du système de sécrétion de type III de la famille Hrp ("Hypersensit ive response and pathogenicity"), ni les gènes gum responsables de la biosynthèse de la gomme x3ll thane. De plus, X albilineans présente une grande variabilité génétique intra-espèce qui a déjà été mise en évidence à l'aide de plusieurs marqueurs (PFGE pour "Pulsed-Field Gel Electrophoresis" et MLSA pour "Multi Locus Sequence Analysis"). Le génome de la souche OPE PC73 de X albilineans comprend deux loci CRISPR (pour "Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats"). Les loci CRISPR sont présents chez de nombreuses bactéries et la quasi-totalité des archéobactéries décrites à ce jour. Ils sont bordés de gènes dits CAS (pour "Crispr ASsociated") et présentent une structure répétitive comportant des séquences uniques appelées espaceurs. Le premier locus CRISPR de la souche OPE PC73 de X. albilineans, appelé CRISPR-I , est associé à 7 gènes CAS et comprend des séquences répétées de 31 pa ires de bases. Le second, appelé CRISPR-2, est associé à 6 gènes CAS et contient des séquences répétées de 28 paires de bases. Au cours de cette étude, nous avons analysé le polymorphisme des espaceurs du CRIPSR- I parmi des souches appartenant au groupe PFGE-B afin de retracer l'histoire des souches de X albilineans responsables de la recrudescence de l'échaudure des feuilles observée dans les années 80 aux Antilles, en Floride et au Texas. Nous avons également analysé le polymorphisme des espaceurs du CRIPSR-2 au sein de souches représentatives de la diversité génétique de X. albilineans afin de mieux comprendre l'histoire évolutive de cette espèce. (Texte intégral)