Résumé
Les interactions protéine/carbohydrate jouent un rôle prépondérant dans de nombreux processus biologiques et pathologiques comme le développement des métastases, la réponse inflammatoire et les infections microbiennes. Pseudomonas aeruginosa (PA) est une bactérie opportuniste qui est impliquée dans 10 à 30 % des infections nosocomiales et qui est résistante à la plupart des antibiothérapies conventionnelles. C’est pourquoi, trouver de nouvelles molécules anti-infectieuses ciblant des lectines impliquées dans la virulence de PA est un enjeu sociétal majeur. Afin de comprendre les relations structure-activité entre une molécule multivalente (glycocluster) et une lectine de PA, une biopuce à glycocluster a été développé au sein de notre laboratoire [1]. Pour ce faire, les glycoclusters sont immobilisés sur la biopuce et leurs interactions avec une lectine sont testées. Cet outil permet un criblage à haut débit et une analyse multiplexée des interactions glycocluster/lectine tout en utilisant que quelques picomoles d’échantillons. Cette biopuce permet également d'évaluer l'interaction de chaque glycocluster avec une lectine par une mesure de fluorescence, d’IC50 et de Kd [2]. Dans le but d’explorer les limites de cet outil, l’impact des conditions expérimentales sur la mesure d’IC50 et de Kd a été étudié. Nous nous sommes notamment intéressés à l’impact de la densité de surface en glycocluster. Plusieurs densités de surface en glycocluster ont été testées et pour chaque densité, un IC50 et un Kd ont été mesurés. De cette étude est notamment ressorti que la densité de surface en glycocluster influençait la valeur de l’IC50 mais n’impactait pas celle du Kd. REFERENCES [1] Y. Chevolot, E. Laurenceau, M. Phaner-Goutorbe, V. Monnier, E. Souteyrand, A. Meyer, T. Géhin, J.-J. Vasseur, and F. Morvan, “DNA directed immobilization glycocluster array: applications and perspectives.,” Curr. Opin. Chem. Biol., vol. 18C, pp. 46–54, Feb. 2014. [2] A. Goudot, G. Pourceau, A. Meyer, T. Gehin, S. Vidal, J. J. Vasseur, F. Morvan, E. Souteyrand, and Y. Chevolot, “Quantitative analysis (Kd and IC50) of glycoconjugates interactions with a bacterial lectin on a carbohydrate microarray with DNA Direct Immobilization (DDI),” Biosens. Bioelectron., vol. 40, no. 1, pp. 153–160, 2013.