Résumé
Les virus entériques sont à l'origine de gastroentérites chez l'humain et chez l'animal, mais ils ont aussi été associés à des pathologies extra-intestinales graves. Ces virus touchent un large panel d'espèces de vertébrés, dont des oiseaux et des mammifères. Les contacts étroits et fréquents entre humains et animaux peuvent potentiellement induire un risque de zoonoses. Environ 60% des zoonoses chez les humains proviennent de la faune sauvage. Pour prévenir de futures épidémies de zoonoses, une meilleure description des virus circulant chez les animaux domestiques est nécessaire, car ils sont à l'interface entre humains et faune sauvage. Nous avons donc recherché la présence d'astrovirus, d'entérovirus et de calicivirus - trois des principales familles virales causant des maladies entériques à la fois chez l'humain et chez l'animal - chez les chèvres, les moutons et les chiens vivant dans les villages du nord-est du Gabon. Nous avons identifié la présence d'astrovirus chez les chèvres, celle d'un calicivirus chez un chien, et d'entérovirus chez les trois espèces. Tous les virus détectés étaient à l'origine de pathologies animales, mais pas des pathologies propres à la faune sauvages. Cependant, nous avons aussi démontré que certains entérovirus à l'origine de pathologies chez l'humain infectent également les chèvres et les chiens. De nouvelles études seront donc nécessaires pour mieux comprendre le rôle des animaux domestiques comme amplificateurs de zoonoses en sens inverse.