Résumé
Le manguier, l'anacardier (noix de Cajou), le faux-poivrier et le prunier de Cythère sont infectés par des Xanthomonas qui présentent une grande variabilité génétique et phénotypique. S'agit-il de plusieurs pathovars ou de souches d'un seul pathovar différant par leur, pouvoir pathogène ? Quelles sont les relations entre ces différents groupes de souches, comment se placent-ils par rapport aux autres groupes de Xanthomonas ? Comment peut-on les ranger et les appeler pour refléter ces relations ? Une approche polyphasique a été employée pour répondre à ces questions: tests de pouvoir pathogène, génotypage par AFLP, séquençage de gènes de ménage (MLSA) et hybridations ADN-ADN sur des collections de souches représentatives des Xanthomonas infectant les anacardiacées et des différents pathovars et espèces de Xanthomonas. Les tests de pouvoir pathogène et le génotypage par AFLP montrent que l'on peut distinguer trois groupes de souches qui sont apparentées à l'espèce axonopodis telle que définie en 1995 (3) et appartenant à des sous-groupes génétiques distincts (1). Nous proposons de les classer en trois pathovars: Pathovar mangiferaeindicae (sensu novo) qui contient les souches isolées de manguier et faux-poivrier, spécialisées pour le pouvoir pathogène sur leur hôte d'origine mais qui forment un groupe génétique homogène inclus dans le groupe 9.5 de X. axonopodis. Pathovar anacardii qui contient les souches isolées d'anacardier (ainsi que celles isolées de manguier au Brésil), spécialisées pour le pouvoir pathogène sur anacardier. Elle font partie du groupe 9.6 de X. axonopodis. Pathovar spondiae qui contient les souches isolées de prunier de Cythère, spécialisées sur leur hôte d'origine et inclus dans le groupe 9.4 de X. axonopodis. Les techniques d'hybridation ADN-ADN, de génotypage AFLP et MLSA permettent de classer (et reclasser) ces pathovars parmi les espèces de Xanthomonas: Les pathovars mangiferaeindicae, anacardii et citri (agent du chancre bactérien des agrumes) appartiennent à la même espèce. Le pathovar mangiferaeindicae n'appartient à aucune espèce actuellement définie. Les pathovars mangiferaeindicae, anacardii et citri ne sont pas apparentées à la souche type de l'espèce axonopodis donc n'appartiennent pas à cette espèce. Nous proposons de ranger les souches des groupes 9.5 et 9.6 au sein de l'espèce citri, nouvellement élevée (2). Par conséquent, l'agent responsable de la maladie des taches noires du manguier est appelé Xanthomonas citri pv. mangiferaeindicae, l'agent responsable de la maladie des taches noires de l'anacardier est appelé Xanthomonas citri pv. anacardii et l'agent responsable du dépérissement bactérien du prunier de Cythère est appelé Xanthomonas axonopodis pv. spondiae. (Texte intégral)