Résumé
Etude sur biopuce et modélisation moléculaire de l’influence de l’aglycone aromatique sur les interactions de galactoclusters avec la lectine PA-IL de Pseudomonas aeruginosa. Lucie Dupin1, Francesca Casoni2, Gérard Vergoten3, Eliane Souteyrand1, Jean-Jacques Vasseur2, Emmanuelle Laurenceau1, François Morvan2, Albert Meyer2, Thomas Gehin1, Olivier Vidal3, Yann Chevolot1 1 UMR5270, Institut des Nanotechnologies de Lyon, CNRS/Université de Lyon, ECL, 36 avenue Guy de Collongue, 69134 Ecully Cedex 2 UMR 5247, Institut des Biomolécules Max Mousseron, CNRS/Université Montpellier, Université de Montpellier, CC1704, Place E. Bataillon 34095 Montpellier Cedex 5 3 UMR 8576, Unité de Glycobiologie Structurelle et Fonctionnelle,CNRS/Université de Lille 1, Cité Scientifique, Avenue Mendeleiev, Bat C9, 59655 Villeneuve d'Ascq cedex Pseudomonas aeruginosa (PA) est une bactérie opportuniste impliquée dans 10 à 30% des maladies nosocomiales et qui est la principale cause de mortalité chez les patients atteints de la mucoviscidose. Cette bactérie développe des résistances à la plupart des antibiothérapies conventionnelles, c’est pourquoi trouver de nouvelles approches thérapeutiques est un enjeu sociétal. Une de ces approches est de cibler des facteurs de virulence de PA impliqués dans la formation du biofilm, grâce à des molécules multivalentes de fortes affinités appelées glycoclusters. Parmi ces facteurs de virulence, PA-IL est une lectine de PA qui reconnait spécifiquement le D-galactose. Afin de cribler les interactions lectine/glycoclusters, il a été conçu un microsystème d’analyse basée sur une technologie biopuce. Cet outil permet une analyse à haut débit tout en utilisant que quelques picomoles d’échantillon. Les interactions lectine/glycoclusters sont évaluées par une mesure de fluorescence, d’IC50 et de Kd1. Le criblage sur biopuce de plus de 150 galactoclusters a permis de mettre en évidence que des molécules présentant un aglycone phényle proche du galactose étaient affins pour PA-IL2. L’influence de 4 aglycones aromatiques sur l’interaction avec PA-IL a été étudié par des mesures d’IC50 et de Kd dans le but de mieux comprendre les paramètres structures/affinité et notamment le rôle de l’aglycone aromatique. Il est ressortit, que les galactoclusters possédant un aglycone de type naphtyle ou biphényle augmentaient significativement l’interaction avec PA-IL. Enfin, des études de docking menées en parallèle ont aboutit aux mêmes conclusions3. (1) Goudot, A.; Pourceau, G.; Meyer, A.; Gehin, T.; Vidal, S.; Vasseur, J. J.; Morvan, F.; Souteyrand, E.; Chevolot, Y. Biosens. Bioelectron. 2013, 40, 153–160. (2) Gerland, B.; Goudot, A.; Ligeour, C.; Pourceau, G.; Meyer, A.; Vidal, S.; Gehin, T.; Vidal, O.; Souteyrand, E.; Vasseur, J.-J.; Chevolot, Y.; Morvan, F. Bioconjug. Chem. 2014, 25, 379–392. (3) Casoni, F.; Dupin, L.; Vergoten, G.; Meyer, A.; Ligeour, C.; Géhin, T.; Vidal, O.; Souteyrand, E.; Vasseur, J.-J.; Chevolot, Y.; Morvan, F. Org. Biomol. Chem. 2014, 12, 9166–9179.