Résumé
1. Introduction et objectif La surveillance de l’antibiorésistance permet une prévention argumentée et permet d’être réactif pour contrôler les crises. Le suivi individualisé des patients porteurs de bactéries hautement résistantes émergentes (BHRe) et de leurs contacts est recommandé mais les données épidémiologiques qui en découlent sont parcellaires. De nouveaux outils pourraient alléger le suivi et rendre la surveillance plus exhaustive. L’épidémiologie basée sur les eaux usées s’est montrée efficace lors de la pandémie COVID-19. Nous proposons une surveillance sur 18 semaines par quantification de 3 gènes associés aux BHRe (blaOXA-48, blaNDM, vanA) et blaCTX-M en tant que « standard d’endémicité » dans les eaux usées de 3 bâtiments hospitaliers accueillant des patients avec différents risques de portage de BHRe.2. Matériel et MéthodesLes eaux usées sont collectées par préleveur automatique (IAGE®) à la sortie de 3 bâtiments, HOM, DIG et LN. HOM et DIG accueillent un taux élevé de patients BHRe. LN (400 lits), accueillant des patients sans risque ajouté de portage BHRe, est pris pour déterminer un signal de base. Les gènes blaCTX-M, blaOXA-48, blaNDM et vanA sont quantifiés par qPCR et ddPCR par rapport au gène d’ARNr 16S. Enterobactéries productrices de carbapénémase (EPC) et entérocoques résistants à la vancomycine (ERV) sont dénombrés par culture sur milieux sélectifs et identifiés par MALDI-TOF-SM.3. RésultatsLe signal varie selon les gènes, les bâtiments et dans le temps, confirmant l’intérêt potentiel de cette approche comme outil de surveillance. La quantification des gènes dans le bâtiment LN donne un signal de base régulier dans le temps et significativement différent des signaux HOM et DIG, ce qui permet d’envisager la détermination de seuils cible/alerte. Le signal blaOXA-48 est souvent comparable ou supérieur au signal blaCTX-M y compris dans le bâtiment LN, suggérant la possible sous-évaluation de la circulation des EPC OXA-48. Les EPC du genre Citrobacter ont une forte prévalence. vanA et blaNDM présentent une dynamique épidémique / sporadique comme attendu. La corrélation entre le signal et la présence d’un patient porteur connu est faible dû au faible nombre de patients porteurs connus sur la période. 4. ConclusionNous montrons la faisabilité de l’épidémiologie de l’antibiorésistance basée sur les eaux usées à l’hôpital. La relation nombre de patients porteurs / copies de gènes de résistance dans les eaux usées doit être étudiée. Elle est certainement moins directe que celle observée pour le SARS-CoV-2 du fait des transferts de gènes entre bactéries.