Résumé
Le bassin mediterraneen, aire de distribution naturelle de la Legumineuse modele Medicago truncatula, constitue un cadre ideal pour etudier l’impact des conditions climatiques sur la variation des caracteres adaptatifs. La date de floraison est un caractere potentiellement implique dans la reponse a un ample spectre de pressions selectives : climat, herbivorie, pathogenes, pollinisateurs, et explique une bonne proportion de la variation de la distribution geographique des especes sauvages et cultivees. Dans cette etude nous examinons la diversite naturelle des genes impliques dans la variation de la date de floraison chez M. truncatula (Hecht et al. 2005), espece annuelle et autogame, pour la mettre en relation avec les variables climatiques et des caracteres de floraison . Pour cela, nous utilisons un jeu de donnees issu du sequencage haut debit de 192 plantes qui representent la totalite de l’aire de distribution de l’espece. Une methode multivariee, l'Analyse Discriminant des Composantes Principales (DaPC ; Jombart et al. 2010), a ete utilisee pour inferer la structure genetique neutre de cet echantillon. L’information de 34.550 sites nucleotidiques intergeniques repartis sur l'ensemble du genome montre une partition majeure en deux groupes geographiques : un groupe occidental regroupant des plantes originaires de la peninsule iberique et du Maroc et un deuxieme groupe plus oriental. La relation entre la variation genotypique et la variation environnementale a ete examinee a l'aide de methodes de regression, en tenant compte de la structure genetique et de l’apparentement entre individus intra groupe, pour reperer les locus potentiellement impliques dans la reponse aux conditions climatiques. Les resultats preliminaires sur un sous-echantillon de 330 locus SNP montrent jusqu'a 30% d'associations significatives. La validation de ces locus potentiellement impliques dans l'adaptation locale a l'aide de donnees phenotypiques, par genetique d’association, est en cours.