Résumé
L'objectif de cette étude est de mieux connaître les bases du déterminisme génétique de la résistance des cacaoyers à trois espèces de Phytophthora (P. palmivora, P. megakarya, P. capsici) en localisant les différentes régions du génome impliquées dans le caractère de résistance (QTLs). L'étude a été réalisée sur une descendance créée en Côte d'Ivoire avec comme parent femelle un individu hybride de Scavina 6, sélectionné au champ pour son niveau élevé de résistance et comme parent mâle l'Amelonado IFC1 relativement sensible.151 individus plein-frères ont été élevés en serre à Montpellier. Le niveau de résistance a été évalué par inoculation sur feuilles avec 2 isolats différents pour chacune des 3 espèces. Des différences significatives du niveau de résistance ont été observées entre les individus pour les 3 espèces. Dix groupes de liaison correspondant aux 10 chromosomes de T. cacao ont été identifiés avec 213 marqueurs. Ces loci correspondent à 190 marqueurs AFLP et à 23 microsatellites. La longueur totale de la carte atteint 682 cM et la distance moyenne entre marqueurs est de 3,2 cM. Des QTLs ont été identifiés pour chaque isolat de Phytophthora. Au total 11 QTLs ont été détectés, 3 sur le chromosome 5 et 2 sur les chromosomes 1, 3, et 6 et un pour les chromosomes 4 et 7. Pour P. palmivora, 6 QTLs sont significatifs et expliquent 57% de la variation pour un des isolats et 4 QTLs expliquent 35% de la variation pour l'autre isolat. Pour P. megakarya, 4 QTLs sont significatifs et expliquent 21.7% de la variation. Pour P. capsici, 2 QTLs sont significatifs et expliquent 19,6% de la variation. Trois QTLs significatifs sont communs à plus d'une espèce, il existe egalement des QTLS spécifiques à un isolat d'une seule espèce. Cette étude révèle plusieurs zones du génome impliquées dans la résistance au Phytophthora. Le pourcentage élevé de la variance expliqué par ces QTLs permet d'envisager une sélection assistée par marqueur.