Résumé
Le virus de la panachure jaune du riz (rice yellow mottle virus - RYMV) est la maladie virale du riz la plus importante aujourd'hui en Afrique. Décrit pour la première fois en 1966 au Kenya, il est de nos jours vraissemblablement présent dans presque tous les pays d'Afrique où le riz est produit. En dépit de cette progression rapide et des dégâts qu'elle provoque dans les rizières, très peu de travaux jusqu'à ce jour ont été consacrés à l'écologie, l'épidémiologie et aux méthodes de lutte. l'utilisation des variété résistantes et la destruction des résidus après la récolte ont été jusque là conseillées pour prévenir le développement du RYMV. Cependant la maladie est de plus en plus présente dans les rizières africaines. Nous rapportons ici les travaux effectués et les résultats obtenus sur les caractéristiques biologiques, sérologiques et moléculaires de quelques isolats du RYMV, originaires de la côte d'ivoire. 1-Caractérisation biologique des isolats: Le travail a été fait dans un environnement semi-contrôlé et est basé sur le profil de réaction de variétés de riz artificiellement inoculées avec des isolats prélevés dans différentes localités de la Côte d'ivoire. Il s'agit de variétés dont le comportement vis à vis du RYMV est déjà connu. On note sur la base du profil de réaction des variétés de riz testées que tous les isolats inoculés ont entrainé le développement de symptômes caractéristiques du RYMV. Ce résultat confirme l'origine virale des isolats. Cependant avec certaines variétés, l'apparition des premiers symptômes après l'inoculation avec certains isolats est un processus lent. Dans l'ensemble, la réaction des variétés à l'inoculation révèle une interaction significative dans certains cas entre celles-ci et les isolats. On note des isolats plus agressifs, moyennement agressifs et faiblement agressifs. Cette classification des isolats selon leur agressivité n'est pas liée à leur origine géographique. 2-Caractérisation sérologique des isolats: Elle a été faite par la méthode de double diffusion aigarose et le test ELISA (Enzyme linked immunosorbent assay). Tous les isolats testés par la méthode de double diffusion agarose ont réagi avec les serums M1, Mg et CI par la formation d'arc de précipitation. Ce résultat démontre que ces isolats sont sérologiquement liés. Cependant, la formation dépéron entre certains isolats suggère l'existence dune variabilité antigénique entre ceux-ci. Deux sérogroupes ont été mis en évidence quelque soit le serurn choisi. On note la formation d'épéron entre les isolats d'un groupe et ceux de l'autre, ce qui n'est pas le cas entre les individus du même groupe. Cette répartition des isolats en fonction de leur propriété sérologique se fait par rapport à un axe Nord-est/Sud-ouest. Les anticorps polyclonaux préparés contre les isolats RYMVMali (ml) et Madagascar (Mg) détectend en ELISA les isolats des deux groupes mis en évidence. On note cependant une plus grande affinité du serum M1 pour les isolats du groupe Nord-Est. Ce résultat confirme l'existence de deux sérogroupes au sein des isolats du RYMV testés. Les anticorps monoclonaux dirigés contre les isolats M1 et Mg n'ont pas permis de mettre en évidence des différences au sein des isolats. En effet, tous les isolats testés ont été détectés par la série de monoclonaux utilisée. Ce résultat indique que ces monoclonaux sont dirigés contre les mêmes sites antigéniques. 3-Caractérisation moléculaires des isolats: Elle a été faite par la méthode RT-PCR (reverse transcriptase polymerase chain reaction) qui consiste en l'extraction et en la transcription de l'acide ribonucléique (ARN) en acide désoxyribonucléique complémentaire (ADNc) (RT) et en l'amplification de celui-ci en ADN double brins en présence d'oligonucléotides spécifiques du génome virai (PCR). Le test a été fait avec de l'ARN total purifié. L'analyse par électrophorèse sur gel d'agarose à 1,5% du produit obtenu montre que les isolats du groupe du SUD-Ouest ont été amplifiés, ce qui