Abstract
L’analyse d'expériences bioinformatiques comprend la comparaison des nouveaux résultats obtenus auxdonnées existantes. Durant ces trente dernières années, les scientifiques ont du faire face à une avalanche dedonnées, de différents types, et présentes dans une multitude de bases de données publiques. L’accès auxdonnées publiques se fait par l’interrogation de portails (tels que le portail Entrez du NCBI) au moyen demots clés. Cependant, deux requêtes très similaires peuvent fournir des ensembles de réponses différentsconduisant l’utilisateur à devoir tester différentes reformulations de ses requêtes (termes synonymes,variantes orthographiques, abréviations).... Les résultats obtenus doivent ensuite être filtrés, comparés... Enoutre, chaque ensemble de résultats est classé par le portail (en utilisant le nombre d'occurrences du mot-clédans chaque résultat). Cependant, lorsque plusieurs reformulations sont considérées, il n'est pas simple deproduire un classement triant par ordre de pertinence l'ensemble des résultats recueillis séparément, d'autantque ces résultats peuvent être fournis par centaines.Dans cette démonstration, nous présentons ConQuR-Bio (http://conqur-bio.lri.fr) qui permet auxutilisateurs d'interroger les bases de données publiques du NCBI tout en générant automatiquement toutes lesreformulations possibles et fournit des réponses triées en utilisant des techniques de consensus de classement(ou agrégation de classements). Notre démonstration montrera l’intérêt de notre approche pour des requêtesbiomédicales, lors de la recherche de gènes issus d’EntrezGene et impliqués dans des maladies.